Identificación de la presencia del subcomplejo GBAF de SWI/SNF, interacciones intra-complejo y dinámicas transcripcionales durante el desarrollo porcino temprano
Autores: Innis, Sarah; Alpsoy, Aktan; Crodian, Jennifer; Tseng, Yu-Chun; Dykhuizen, Emily; Cabot, Birgit; Cabot, Ryan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación de la presencia del subcomplejo GBAF de SWI/SNF, interacciones intra-complejo y dinámicas transcripcionales durante el desarrollo porcino temprano
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Genética
Factores ambientales
Mecanismos epigenéticos
Complejo de remodelación de cromatina GBAF
Cerdos
Etapas del desarrollo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Entender la compleja interacción entre la genética y los factores ambientales es vital para mejorar la eficiencia de la producción ganadera mientras se protege la salud animal. A pesar de los extensos estudios sobre genes específicos de producción en el ganado, explorar cómo los mecanismos epigenéticos y las modificaciones heredables gobiernan el crecimiento y desarrollo animal sigue siendo una frontera poco explorada con posibles implicaciones en todas las etapas de la vida. Este estudio se centra en el complejo de remodelación de cromatina GBAF y evalúa su presencia durante el desarrollo embrionario y fetal en cerdos. Se emplearon técnicas de inmunocitoquímica y co-inmunoprecipitación para investigar la presencia e interacciones de las subunidades de GBAF BRD9 y GLTSCR1 en ovocitos porcinos, embriones en preimplantación y líneas celulares, y se analizaron las dinámicas transcripcionales de las subunidades de GBAF a través de estas etapas clave de desarrollo utilizando conjuntos de datos de RNA-seq existentes. Se identificaron BRD9 y GLTSCR1 en todas las etapas representadas, y se mostró una interacción entre GLTSCR1 y BAF170 en células PTr2 y PFF. Nuestros hallazgos destacan la presencia ubicua de GBAF en el desarrollo temprano porcino y la asociación potencialmente novedosa entre GLTSCR1 y BAF170 en cerdos. Los hallazgos sobre las dinámicas transcripcionales pueden sugerir contribuciones específicas de GBAF durante eventos clave de desarrollo. Este estudio contribuye a la creciente comprensión de los reguladores epigenéticos tanto en el desarrollo porcino como en el de mamíferos, enfatizando las implicaciones de GBAF como modulador de eventos clave de desarrollo.
Descripción
Entender la compleja interacción entre la genética y los factores ambientales es vital para mejorar la eficiencia de la producción ganadera mientras se protege la salud animal. A pesar de los extensos estudios sobre genes específicos de producción en el ganado, explorar cómo los mecanismos epigenéticos y las modificaciones heredables gobiernan el crecimiento y desarrollo animal sigue siendo una frontera poco explorada con posibles implicaciones en todas las etapas de la vida. Este estudio se centra en el complejo de remodelación de cromatina GBAF y evalúa su presencia durante el desarrollo embrionario y fetal en cerdos. Se emplearon técnicas de inmunocitoquímica y co-inmunoprecipitación para investigar la presencia e interacciones de las subunidades de GBAF BRD9 y GLTSCR1 en ovocitos porcinos, embriones en preimplantación y líneas celulares, y se analizaron las dinámicas transcripcionales de las subunidades de GBAF a través de estas etapas clave de desarrollo utilizando conjuntos de datos de RNA-seq existentes. Se identificaron BRD9 y GLTSCR1 en todas las etapas representadas, y se mostró una interacción entre GLTSCR1 y BAF170 en células PTr2 y PFF. Nuestros hallazgos destacan la presencia ubicua de GBAF en el desarrollo temprano porcino y la asociación potencialmente novedosa entre GLTSCR1 y BAF170 en cerdos. Los hallazgos sobre las dinámicas transcripcionales pueden sugerir contribuciones específicas de GBAF durante eventos clave de desarrollo. Este estudio contribuye a la creciente comprensión de los reguladores epigenéticos tanto en el desarrollo porcino como en el de mamíferos, enfatizando las implicaciones de GBAF como modulador de eventos clave de desarrollo.