(1) Antecedentes: La carne de ganso es muy valorada por su importancia económica y su gran potencial de mercado debido a sus cualidades deseables, que incluyen un perfil nutricional rico, una textura tierna, un contenido de grasa relativamente bajo y altos niveles de ácidos grasos insaturados beneficiosos. Sin embargo, existe una necesidad urgente de mejorar la cría de gansos identificando marcadores moleculares asociados con la calidad de la carne. (2) Métodos: Evaluamos los rasgos de calidad de la carne, como el color de la carne, la fuerza de corte (SF), la tasa de pérdida durante la cocción (CLR) y el contenido de grasa cruda (CFC), en una población de 215 gansos machos de Sichuan a los 70 días de edad. Se realizó un GWAS para identificar posibles marcadores moleculares asociados con la calidad de la carne de ganso. Además, los SNP seleccionados vinculados a los rasgos de calidad de la carne fueron genotipados utilizando el método MALDI-TOP MS. (3) Resultados: Se obtuvo un conjunto de datos de 2601.19 Gb de datos de WGS de 215 individuos, con una profundidad de secuenciación promedio de 10.89x. El GWAS reveló la identificación de 43 marcadores SNP potencialmente significativos asociados con los rasgos de calidad de la carne en la población de gansos blancos de Sichuan. Además, se identificaron 28 genes como importantes genes candidatos para la calidad de la carne. El análisis de enriquecimiento de genes indicó un enriquecimiento sustancial de genes dentro de una vecindad de 1Mb de los SNP en las vías de digestión y absorción de proteínas y en la vía de metabolismo de glicerolípidos. (4) Conclusión: Este estudio proporciona valiosos conocimientos sobre los mecanismos genéticos y moleculares subyacentes a los rasgos de calidad de la carne de ganso, ofreciendo referencias cruciales para la cría molecular en este campo.