Caracterización de SNPs asociados al riesgo de artritis reumatoide e identificación de nuevos sitios terapéuticos utilizando un enfoque
Autores: Akhtar, Mehran; Ali, Yasir; Islam, Zia-ul; Arshad, Maria; Rauf, Mamoona; Ali, Muhammad; Maodaa, Saleh N.; Al-Farraj, Saleh A.; El-Serehy, Hamed A.; Jalil, Fazal
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Caracterización de SNPs asociados al riesgo de artritis reumatoide e identificación de nuevos sitios terapéuticos utilizando un enfoque
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Polimorfismos de un solo nucleótido
Enfermedades autoinmunitarias
Artritis reumatoide
Expresión génica
Estabilidad del ARNm
Herramientas de bioinformática
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
Se informa que los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) están asociados con muchas enfermedades, incluidas las enfermedades autoinmunes. En la artritis reumatoide (AR), se informa que alrededor de 152 SNP representan aproximadamente el 15% de su heredabilidad. Estos SNP pueden resultar en la alteración de la expresión génica y también pueden afectar la estabilidad del ARNm, lo que resulta en proteínas enfermas. Por lo tanto, para predecir el mecanismo subyacente de estos SNP e identificar nuevos sitios terapéuticos para el tratamiento de la AR, se utilizaron varias herramientas de bioinformática. El efecto dañino de 23 SNP no sinónimos en proteínas utilizando diferentes herramientas sugirió cuatro SNP, incluyendo rs2476601 en , rs5029941 y rs2230926 en , y rs34536443 en como los más dañinos. En total, se predijo que 42 de 76 SNP intrónicos asociados a AR crearían o abolirían sitios de empalme potenciales. Además, el análisis de 11 SNP UTR asociados a AR indicó que solo un SNP, rs1128334, ubicado en 3UTR de causó cambios en el patrón funcional en BRD-BOX. Para la identificación de nuevos sitios terapéuticos para tratar la AR, se establecieron extensas redes de interacción génica con la identificación de 13 sitios potenciales para el desarrollo de medicamentos para la AR, incluidos tres nuevos genes objetivo. El efecto anticipado de estos hallazgos en la patogénesis de la AR puede ser validado aún más en estudios tanto in vivo como in vitro.
Descripción
Se informa que los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) están asociados con muchas enfermedades, incluidas las enfermedades autoinmunes. En la artritis reumatoide (AR), se informa que alrededor de 152 SNP representan aproximadamente el 15% de su heredabilidad. Estos SNP pueden resultar en la alteración de la expresión génica y también pueden afectar la estabilidad del ARNm, lo que resulta en proteínas enfermas. Por lo tanto, para predecir el mecanismo subyacente de estos SNP e identificar nuevos sitios terapéuticos para el tratamiento de la AR, se utilizaron varias herramientas de bioinformática. El efecto dañino de 23 SNP no sinónimos en proteínas utilizando diferentes herramientas sugirió cuatro SNP, incluyendo rs2476601 en , rs5029941 y rs2230926 en , y rs34536443 en como los más dañinos. En total, se predijo que 42 de 76 SNP intrónicos asociados a AR crearían o abolirían sitios de empalme potenciales. Además, el análisis de 11 SNP UTR asociados a AR indicó que solo un SNP, rs1128334, ubicado en 3UTR de causó cambios en el patrón funcional en BRD-BOX. Para la identificación de nuevos sitios terapéuticos para tratar la AR, se establecieron extensas redes de interacción génica con la identificación de 13 sitios potenciales para el desarrollo de medicamentos para la AR, incluidos tres nuevos genes objetivo. El efecto anticipado de estos hallazgos en la patogénesis de la AR puede ser validado aún más en estudios tanto in vivo como in vitro.