El óxido del maní, causado por Speg., es una de las enfermedades foliares más significativas a nivel mundial y tiene un impacto severo en el rendimiento y la calidad del maní. El desarrollo de variedades resistentes a enfermedades se reconoce como una estrategia efectiva para mitigar el daño causado por el óxido del maní. Sin embargo, la base de investigación para comprender el óxido del maní sigue siendo relativamente limitada. En este estudio, identificamos polimorfismos de nucleótido único (SNP) significativos asociados con la resistencia al óxido del maní utilizando una población natural que consiste en 353 accesiones de germoplasma de maní. Estas accesiones fueron analizadas en función de datos de resecuenciación y fenotipos de la enfermedad del óxido en una prueba de laboratorio y tres ensayos de campo. Se identificaron un total de 18 SNP significativos en los cromosomas A05 (5 SNP), A08 (7 SNP) y A12 (6 SNP). Notablemente, tres SNP-Arahy.05_93085395, Arahy.05_93114354 y Arahy.12_4097252-fueron detectados de manera consistente en múltiples entornos. Dentro de sus intervalos de confianza, se anotaron 48 genes, incluidos 9 genes que contienen dominios NLR relacionados funcionalmente con la resistencia a enfermedades en plantas, que pueden servir como genes candidatos para la resistencia al óxido del maní. Este estudio proporciona información sobre los mecanismos regulatorios subyacentes a la resistencia al óxido del maní.