Identificación de Regiones Genómicas Asociadas con Alto Contenido de Zn en Granos de Arroz Pulido Utilizando Genotipado por Secuenciación (GBS)
Autores: Uttam, Goparaju Anurag; Suman, Karre; Jaldhani, Veerendra; Babu, Pulagam Madhu; Rao, Durbha Sanjeeva; Sundaram, Raman Meenakshi; Neeraja, Chirravuri Naga
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Identificación de Regiones Genómicas Asociadas con Alto Contenido de Zn en Granos de Arroz Pulido Utilizando Genotipado por Secuenciación (GBS)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Micronutriente
Arroz enriquecido
Base genética
Regiones genómicas
QTLs
Genes candidatos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
A nivel mundial, el arroz enriquecido con micronutrientes (hierro y zinc) ha sido una solución sostenible y rentable para superar la desnutrición o el hambre oculta. Comprender la base genética e identificar las regiones genómicas para el zinc (Zn) en granos a través de diversos antecedentes genéticos es un paso importante para desarrollar variedades de arroz biofortificadas. En este caso, se utilizó una población de RIL (306 RILs) obtenida de un cruce entre la variedad de arroz de alto rendimiento MTU1010 y la variedad de arroz de alto zinc Ranbir Basmati para identificar la(s) región(es) genómica(s) y los QTL responsables del contenido de zinc (Zn) en los granos. Se emplearon un total de 2746 marcadores SNP que abarcan una distancia genética de 2445 cM para el análisis de loci de rasgos cuantitativos (QTL), lo que resultó en la identificación de 47 QTL para minerales (Zn y Fe) y rasgos agronómicos con un 3.5-36.0% de varianza fenotípica explicada (PVE) a lo largo de las temporadas. En Chr02, se identificaron QTL consistentes para el zinc pulido en granos (qZnPR.2.1) y el zinc marrón (qZnBR.2.2). En Chr09, se identificaron dos QTL adicionales confiables para el zinc marrón en granos (qZnBR.9.1 y qZnBR.9.2). Los QTL de efecto mayor identificados en este estudio estaban asociados con algunos genes clave relacionados con la actividad de transportadores de Zn y Fe. Las regiones genómicas, los genes candidatos y los marcadores moleculares asociados con estos QTL principales serán útiles para la cría asistida por genómica para desarrollar variedades biofortificadas con Zn.
Descripción
A nivel mundial, el arroz enriquecido con micronutrientes (hierro y zinc) ha sido una solución sostenible y rentable para superar la desnutrición o el hambre oculta. Comprender la base genética e identificar las regiones genómicas para el zinc (Zn) en granos a través de diversos antecedentes genéticos es un paso importante para desarrollar variedades de arroz biofortificadas. En este caso, se utilizó una población de RIL (306 RILs) obtenida de un cruce entre la variedad de arroz de alto rendimiento MTU1010 y la variedad de arroz de alto zinc Ranbir Basmati para identificar la(s) región(es) genómica(s) y los QTL responsables del contenido de zinc (Zn) en los granos. Se emplearon un total de 2746 marcadores SNP que abarcan una distancia genética de 2445 cM para el análisis de loci de rasgos cuantitativos (QTL), lo que resultó en la identificación de 47 QTL para minerales (Zn y Fe) y rasgos agronómicos con un 3.5-36.0% de varianza fenotípica explicada (PVE) a lo largo de las temporadas. En Chr02, se identificaron QTL consistentes para el zinc pulido en granos (qZnPR.2.1) y el zinc marrón (qZnBR.2.2). En Chr09, se identificaron dos QTL adicionales confiables para el zinc marrón en granos (qZnBR.9.1 y qZnBR.9.2). Los QTL de efecto mayor identificados en este estudio estaban asociados con algunos genes clave relacionados con la actividad de transportadores de Zn y Fe. Las regiones genómicas, los genes candidatos y los marcadores moleculares asociados con estos QTL principales serán útiles para la cría asistida por genómica para desarrollar variedades biofortificadas con Zn.