Identificación de regiones de proteínas intrínsecamente desordenadas basada en la red neuronal profunda VGG16
Autores: Xu, Pengchang; Zhao, Jiaxiang; Zhang, Jie
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Identificación de regiones de proteínas intrínsecamente desordenadas basada en la red neuronal profunda VGG16
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Ingeniería de Software
Palabras clave
Preciso
Identificación
Proteínas intrínsecamente desordenadas
Red neuronal profunda
VGG16
Proceso biológico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 42
Citaciones: Sin citaciones
La precisión de la identificación de proteínas intrínsecamente desordenadas o regiones de proteínas es de gran importancia, ya que están involucradas en procesos biológicos críticos y relacionadas con diversas enfermedades humanas. En este artículo, desarrollamos una red neuronal profunda basada en la conocida VGG16. Nuestra red neuronal profunda es luego entrenada utilizando 1450 proteínas del conjunto de datos DIS1616 y la red neuronal entrenada se prueba en las 166 proteínas restantes. Nuestra red neuronal entrenada también se prueba en el conjunto de pruebas ciego R80 y MXD494 para demostrar aún más el rendimiento de nuestro modelo. El valor de nuestra red neuronal profunda entrenada se encuentra en el conjunto de pruebas DIS166, en el conjunto de pruebas ciego R80 y en el conjunto de pruebas ciego MXD494. Todos estos valores de nuestra red neuronal profunda entrenada superan los valores correspondientes de los métodos de predicción existentes.
Descripción
La precisión de la identificación de proteínas intrínsecamente desordenadas o regiones de proteínas es de gran importancia, ya que están involucradas en procesos biológicos críticos y relacionadas con diversas enfermedades humanas. En este artículo, desarrollamos una red neuronal profunda basada en la conocida VGG16. Nuestra red neuronal profunda es luego entrenada utilizando 1450 proteínas del conjunto de datos DIS1616 y la red neuronal entrenada se prueba en las 166 proteínas restantes. Nuestra red neuronal entrenada también se prueba en el conjunto de pruebas ciego R80 y MXD494 para demostrar aún más el rendimiento de nuestro modelo. El valor de nuestra red neuronal profunda entrenada se encuentra en el conjunto de pruebas DIS166, en el conjunto de pruebas ciego R80 y en el conjunto de pruebas ciego MXD494. Todos estos valores de nuestra red neuronal profunda entrenada superan los valores correspondientes de los métodos de predicción existentes.