Un carcinoma de células escamosas cutáneo (cSCC) derivado de queratinocitos es la segunda causa más común de cáncer de piel no melanoma. La acumulación de la carga mutacional de genes y el daño al ADN celular causado por factores de riesgo (por ejemplo, la exposición a la radiación ultravioleta) contribuyen a la proliferación aberrante de queratinocitos y a la formación de un cSCC. Un cSCC abarca un espectro de enfermedades que van desde la queratosis actínica precursora (AK) y el carcinoma de células escamosas (SCC) in situ (SCCIS) hasta cSCC invasivos y SCC metastásicos. La evidencia emergente ha revelado que los lncARNs están involucrados en el proceso biológico de un cSCC. Según la teoría reguladora ceRNA, los lncARNs actúan como esponjas naturales de miARN y se interactúan con elementos de respuesta de miARN, regulando así la expresión de ARNm de sus objetivos descendentes. Este estudio fue diseñado para buscar los lncARNs potenciales que pueden convertirse en objetivos terapéuticos o biomarcadores de un cSCC. Considerando que el espíritu del estudio está adecuadamente justificado, recopilamos conjuntos de datos basados en microarreglos de 19 tejidos de cSCC y 12 muestras de piel normal de la base de datos GEO (GSE42677 y GSE45164). Después de filtrar los genes expresados diferencialmente a través de un paquete limma, identificamos 24 lncARNs expresados diferencialmente (DElncARNs) y 3221 ARNm expresados diferencialmente (DEmARNs). Se utilizaron las bases de datos miRcode, miRTarBase, miRDB y TargetScan para predecir los miARNs que podrían interactuar con DElncARNs y DEmARNs. Se retuvieron un total de 137 pares de miARN-lncARN y 221 pares de miARN-ARNm en la red ceRNA, que consiste en 31 miARNs, 11 DElncARNs y 155 DEmARNs. Para el análisis funcional, el proceso biológico más enriquecido fue la unión específica de ADN a secuencias de potenciadores en términos de Gene Ontology (GO). La vía de señalización FoxO, la autofagia y la senescencia celular fueron los términos de enriquecimiento más destacados según un análisis de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG). La combinación de una herramienta STRING y el software Cytoscape (complemento MCODE) identificó cinco ARNm centrales y construyó una red ceRNA asociada a ARNm central. La expresión de cinco ARNm centrales identificados y sus nueve lncARNs relacionados fue validada utilizando el conjunto de datos externo GSE7553. Finalmente, un lncARN HLA-F-AS1 y tres ARNm llamados AGO4, E2F1 y CCND1 fueron validados con los mismos patrones de expresión. Especulamos que el lncARN HLA-F-AS1 puede esponjar miR-17-5p o miR-20b-5p para regular la expresión de CCND1 y E2F1 en el cSCC. El presente estudio puede proporcionar objetivos diagnósticos y terapéuticos potenciales para pacientes con cSCC.