La mancha bacteriana de la panoja, la franja bacteriana de la hoja y la franja marrón bacteriana son enfermedades bacterianas comunes en el arroz que representan amenazas globales para los rendimientos estables de arroz. En este estudio, utilizamos la variedad de arroz HZ, Nekken y su población de 120 RIL como materiales experimentales. Los fenotipos de los padres y los RIL se analizaron cuantitativamente después de la inoculación con , pv. , y subsp. . También se construyeron mapas genéticos de SNP y se utilizaron para el mapeo de QTL de los rasgos cuantitativos. Localizamos 40 loci de QTL en 12 cromosomas. El análisis de genes candidatos relacionados con la resistencia a enfermedades en las regiones de QTL con alto valor de LOD en los cromosomas 1, 3, 4 y 12 reveló una expresión diferencial antes y después del tratamiento, lo que sugiere que los genes identificados mediaron los perfiles variables de resistencia a enfermedades de Huazhan y Nekken2. Estos resultados proporcionan una base importante para el clonaje de QTL resistentes a bacterias de la mancha de panoja, la franja de hoja y la franja marrón en el arroz.