El tamaño del grano es un factor clave que influye en el rendimiento del grano en arroz. Para identificar los genes aún desconocidos que regulan el tamaño del grano en el arroz coreano, desarrollamos una población de líneas recombinantes endogámicas ( = 162) a partir de un cruce entre Odae (grano grande) y Joun (grano pequeño), y medimos seis rasgos, incluidos los pesos de mil granos de semillas con cáscara y sin cáscara, el área del grano, la longitud del grano, el ancho del grano y la relación longitud-anchura del grano utilizando análisis de imágenes de alto rendimiento en las generaciones F y F. Se construyó un mapa genético utilizando 248 marcadores de PCR alelo-específico competitivo (KASP) que eran polimórficos entre los genotipos parentales, y se identificaron 29 QTL que afectan los seis rasgos, de los cuales 15 fueron estables en las generaciones F y F. Notablemente, se detectaron tres grupos de QTL que afectan múltiples rasgos en los cromosomas 6, 7 y 11. Analizamos datos de resecuenciación de genomas completos de Odae y Joun, y seleccionamos genes candidatos para los QTL estables en los grupos identificados que tienen variaciones de alto o moderado impacto entre Odae y Joun y codifican proteínas cuyas familias se ha informado que están relacionadas con la regulación del tamaño del grano. Estos resultados facilitarán la identificación de genes subyacentes a los QTL y promoverán la mejora molecular de variedades de arroz coreano de alto rendimiento.