Estudio de Asociación de Todo el Genoma para Identificar QTL para Rasgos de Carcasa en Ganado Hanwoo Coreano
Autores: Alam, Mohammad Zahangir; Haque, Md Azizul; Iqbal, Asif; Lee, Yun-Mi; Ha, Jae-Jung; Jin, Shil; Park, Byoungho; Kim, Nam-Young; Won, Jeong Il; Kim, Jong-Joo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Estudio de Asociación de Todo el Genoma para Identificar QTL para Rasgos de Carcasa en Ganado Hanwoo Coreano
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Estudio de asociación a nivel del genoma
Características de la canal
Ganado Hanwoo
Chip de SNP
Heredabilidades
Genes candidatos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Este estudio tuvo como objetivo identificar asociaciones genéticas con características de canal en ganado Hanwoo utilizando un estudio de asociación del genoma completo. Se analizaron un total de 9302 fenotipos, y todos los animales fueron genotipados utilizando el chip SNP Illumina Bovine 50K v.3. Las heredabilidades para el peso de la canal (CWT), área del músculo ocular (EMA), grosor de la grasa dorsal (BF) y puntuación de marmoleo (MS) se estimaron en 0.42, 0.36, 0.36 y 0.47, respectivamente, utilizando el modelo GBLUP, y 0.47, 0.37, 0.36 y 0.42, respectivamente, utilizando el modelo Bayes B. Identificamos 129 SNPs comunes utilizando DGEBV y 118 SNPs comunes utilizando GEBV en BTA6, BTA13 y BTA14, sugiriendo su posible asociación con las características de interés. No se encontraron SNPs comunes entre los métodos GBLUP y Bayes B al utilizar residuos como variable de respuesta en GWAS. Los genes candidatos más prometedores para CWT incluyeron , , , , , , , , , , , , , , , , , y . Para EMA, los genes , , , , , , y demostraron significancia. De manera similar, , , , y estaban asociados con BF, mientras que , , , y estaban asociados con MS. Este hallazgo ofrece valiosos conocimientos sobre regiones genómicas y mecanismos moleculares que influyen en las características de canal de Hanwoo, ayudando a estrategias de cría eficientes.
Descripción
Este estudio tuvo como objetivo identificar asociaciones genéticas con características de canal en ganado Hanwoo utilizando un estudio de asociación del genoma completo. Se analizaron un total de 9302 fenotipos, y todos los animales fueron genotipados utilizando el chip SNP Illumina Bovine 50K v.3. Las heredabilidades para el peso de la canal (CWT), área del músculo ocular (EMA), grosor de la grasa dorsal (BF) y puntuación de marmoleo (MS) se estimaron en 0.42, 0.36, 0.36 y 0.47, respectivamente, utilizando el modelo GBLUP, y 0.47, 0.37, 0.36 y 0.42, respectivamente, utilizando el modelo Bayes B. Identificamos 129 SNPs comunes utilizando DGEBV y 118 SNPs comunes utilizando GEBV en BTA6, BTA13 y BTA14, sugiriendo su posible asociación con las características de interés. No se encontraron SNPs comunes entre los métodos GBLUP y Bayes B al utilizar residuos como variable de respuesta en GWAS. Los genes candidatos más prometedores para CWT incluyeron , , , , , , , , , , , , , , , , , y . Para EMA, los genes , , , , , , y demostraron significancia. De manera similar, , , , y estaban asociados con BF, mientras que , , , y estaban asociados con MS. Este hallazgo ofrece valiosos conocimientos sobre regiones genómicas y mecanismos moleculares que influyen en las características de canal de Hanwoo, ayudando a estrategias de cría eficientes.