Los microARN (miARN) son pequeñas moléculas de ARN no codificante de 21-23 nucleótidos que controlan la expresión génica a nivel post-transcripcional. Se ha demostrado que desempeñan un papel vital en una amplia variedad de procesos biológicos y se observa una expresión desregulada de miARN en muchas patologías. Comprender el mecanismo de acción e identificar los objetivos de ARNm funcionalmente importantes de un miARN específico son esenciales para desentrañar su función biológica y para ayudar en el desarrollo de fármacos basados en miARN. Esta revisión resume la comprensión actual de los aspectos mecánicos de la represión génica mediada por miARN y se centra en los diferentes enfoques para la identificación de objetivos de miARN que se han propuesto en los últimos años.