El maní cultivado (L.) es un cultivo oleaginoso importante en todo el mundo, y la composición de ácidos grasos es un determinante principal de la calidad del aceite de maní. En el presente estudio, realizamos un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS) para nueve rasgos de ácidos grasos utilizando las secuencias del genoma completo de 160 variedades representativas de maní chino y identificamos de 6 a 1195 SNPs significativos para diferentes contenidos de ácidos grasos. En particular, para el ácido oleico y el ácido linoleico, se encontraron dos grupos de SNPs pico en Arahy.09 y Arahy.19 que contenían la mayoría de los SNPs significativos asociados con estos dos ácidos grasos. Además, una proporción significativa de los genes candidatos identificados en Arahy.09 se superpone con aquellos identificados en estudios anteriores, entre los cuales tres genes candidatos son de especial interés. Uno posee un SNP missense significativo y codifica un gen candidato conocido. El segundo gen es el más cercano al SNP más significativo para el ácido linoleico. Codifica una proteína MYB que ha demostrado impactar la biosíntesis de ácidos grasos. El tercer gen alberga un SNP missense y codifica una proteína que contiene un dominio JmjC. La diferencia fenotípica significativa en el ácido oleico/ácido linoleico entre los genotipos en los primeros y terceros genes candidatos fue confirmada adicionalmente con el análisis PARMS. Además, también hemos identificado diferentes genes candidatos (es decir, , , y ) para los ácidos grasos restantes. Nuestros hallazgos pueden ayudarnos a comprender mejor la base genética de los contenidos de ácidos grasos en el maní y pueden tener un gran potencial para mejorar la calidad del maní en el futuro.