El lino se cultiva en todo el mundo para la producción de semillas y fibra. Las variedades de linaza difieren en su composición de aceite y se utilizan en la producción farmacéutica, alimentaria, de piensos e industrial. El campo de aplicación depende principalmente del contenido de ácidos grasos linoleico (LIO) y linolénico (LIN). Las mutaciones inactivadoras en los genes y conducen a una disminución en el contenido de LIN y un aumento en el contenido de LIO. Para la identificación de las tres mutaciones de bajo LIN más comunes en las variedades de lino (G-a-A en el exón 1 que sustituye el triptófano por un codón de parada, C-a-T en el exón 5 que lleva a la sustitución de arginina por un codón de parada, y C-a-T en el exón 2 que resulta en la sustitución de histidina por tirosina), se propusieron tres enfoques: (1) secuenciación profunda dirigida, (2) análisis de fusión de alta resolución (HRM), (3) marcadores de secuencias polimórficas amplificadas cortadas (CAPS). Se probaron en más de mil muestras de lino de varios tipos y mostraron resultados prometedores. Los enfoques propuestos pueden utilizarse en la selección asistida por marcadores para elegir pares de padres para cruces, separar variedades heterogéneas en biotipos y seleccionar genotipos con alelos homocigotos deseados de los genes y en las primeras etapas de la cría para el desarrollo efectivo de variedades con un contenido particular de LIN y LIO, así como en estudios básicos de los mecanismos moleculares de la síntesis de ácidos grasos en las semillas de lino para seleccionar genotipos adecuados a las tareas.