Los sRNAs (pequeños ARN) juegan un papel importante en la regulación de la inmunidad de las plantas contra una variedad de patógenos. En este estudio, se realizó un análisis de secuenciación de sRNA para identificar miARN (microARN) durante la interacción de la papa y . En total, se identificaron 171 miARN de papa, 43 de los cuales fueron anotados en la base de datos de miARN y 128 fueron asignados como nuevos miARN en este estudio. Estos miARN de papa pueden dirigirse a 878 genes de papa y la mitad de ellos codifican proteínas de resistencia. Cincuenta y tres miARN de papa pueden dirigirse a 194 genes. Se predijo que tres miARN de papa (nuevos 72, 133 y 140) tienen objetivos solo en el genoma. La expresión transitoria de miARN y el ensayo de inoculación mostraron que miR396, miR166, miR6149-5P, novel133 o novel140 promovieron la colonización, mientras que miR394 inhibió la colonización en las hojas. Un experimento de degradación de un objetivo de miARN artificial (amiARN) demostró que miR394 podría dirigirse tanto al gen de papa () como a genes. miR396 se dirige al gen multicistatina () y miR6149-5p podría cortar el gen de la proteína F-box de la galactosa oxidasa (). Este estudio proporciona nueva información sobre el aspecto de la regulación inmune entre reinos en la interacción papa- a nivel de regulación de sRNAs.