Marcadores de polimorfismo basados en alta resolución de fusión y en sitios de inserción para el análisis de la variabilidad del trigo y la selección de genes candidatos en los loci de MQTL de sequía y calor
Autores: Mérida-García, Rosa; Gálvez, Sergio; Paux, Etienne; Dorado, Gabriel; Pascual, Laura; Giraldo, Patricia; Hernandez, Pilar
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
Marcadores de polimorfismo basados en alta resolución de fusión y en sitios de inserción para el análisis de la variabilidad del trigo y la selección de genes candidatos en los loci de MQTL de sequía y calor
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Marcadores moleculares
Trigo
Análisis de fusión de alta resolución
Genes
Loci de rasgos cuantitativos
Estrés por sequía
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
El uso práctico de marcadores moleculares es facilitado por técnicas de detección rentables. En este trabajo, se establecieron marcadores de polimorfismos basados en sitios de inserción de trigo (ISBP) para genotipificación utilizando análisis de fusión de alta resolución (HRM). Se desarrollaron ensayos polimórficos HRM-ISBP para los cromosomas 4A y 3B del trigo y se utilizaron para la evaluación de la variabilidad del trigo. Las secuencias de los marcadores se mapearon contra la secuencia de referencia del genoma del trigo, apuntando a genes interesantes. Esos genes estaban ubicados dentro o en proximidad a loci de rasgos cuantitativos (QTL) o meta-loci de rasgos cuantitativos (MQTL) previamente descritos para la tolerancia a la sequía y al calor, así como para los rendimientos y rasgos relacionados con el rendimiento. Dieciocho de los marcadores utilizados etiquetaron genes relacionados con la sequía y, interesantemente, ocho de los genes se expresaron diferencialmente bajo diferentes condiciones de estrés abiótico. Estos resultados confirmaron que HRM es una herramienta rentable y eficiente para los programas de mejoramiento de trigo.
Descripción
El uso práctico de marcadores moleculares es facilitado por técnicas de detección rentables. En este trabajo, se establecieron marcadores de polimorfismos basados en sitios de inserción de trigo (ISBP) para genotipificación utilizando análisis de fusión de alta resolución (HRM). Se desarrollaron ensayos polimórficos HRM-ISBP para los cromosomas 4A y 3B del trigo y se utilizaron para la evaluación de la variabilidad del trigo. Las secuencias de los marcadores se mapearon contra la secuencia de referencia del genoma del trigo, apuntando a genes interesantes. Esos genes estaban ubicados dentro o en proximidad a loci de rasgos cuantitativos (QTL) o meta-loci de rasgos cuantitativos (MQTL) previamente descritos para la tolerancia a la sequía y al calor, así como para los rendimientos y rasgos relacionados con el rendimiento. Dieciocho de los marcadores utilizados etiquetaron genes relacionados con la sequía y, interesantemente, ocho de los genes se expresaron diferencialmente bajo diferentes condiciones de estrés abiótico. Estos resultados confirmaron que HRM es una herramienta rentable y eficiente para los programas de mejoramiento de trigo.