Identificación de loci de rasgos cuantitativos asociados con la resistencia al oídio en cebada de primavera bajo condiciones del sureste de Kazajistán
Autores: Genievskaya, Yuliya; Zatybekov, Alibek; Abugalieva, Saule; Turuspekov, Yerlan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación de loci de rasgos cuantitativos asociados con la resistencia al oídio en cebada de primavera bajo condiciones del sureste de Kazajistán
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Cebada
Resistencia a PM
QTLs
Haplotipos
Factores genéticos
Estudio de asociación a nivel genómico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La cebada (L.) es uno de los cultivos de cereales más producidos en el mundo. Tradicionalmente se ha utilizado para la producción de piensos para animales y para la maltería, así como para el consumo humano. Sin embargo, su producción se ve altamente afectada por factores de estrés biótico, particularmente el patógeno fúngico (DC.) f. sp. (), que causa el oídio (PM). En este estudio, se evaluó una colección de 406 accesiones de cebada de EE. UU., Kazajistán, Europa y África en cuanto a su resistencia al PM durante un período de 3 años en el sureste de Kazajistán. La colección se cultivó en el campo en 2020, 2021 y 2022 y se genotipó utilizando el chip SNP Illumina de 9K. Se realizó un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS) para identificar los loci de rasgos cuantitativos (QTL) asociados con la resistencia al PM. Como resultado, se detectaron siete QTL para la resistencia al PM en los cromosomas 4H, 5H y 7H (valores FDR < 0.05). Las posiciones genéticas de dos QTL fueron similares a las de los QTL de resistencia al PM reportados previamente en la literatura científica, lo que sugiere que los cinco QTL restantes son nuevos factores genéticos putativos para el rasgo estudiado. El análisis de haplotipos para siete QTL reveló tres haplotipos que estaban asociados con la resistencia total al PM y un haplotipo asociado con la alta severidad del PM en la colección de cebada. Los QTL e haplotipos identificados asociados con la resistencia al PM de la cebada pueden ser utilizados para análisis adicionales, apilamiento de rasgos y selección asistida por marcadores.
Descripción
La cebada (L.) es uno de los cultivos de cereales más producidos en el mundo. Tradicionalmente se ha utilizado para la producción de piensos para animales y para la maltería, así como para el consumo humano. Sin embargo, su producción se ve altamente afectada por factores de estrés biótico, particularmente el patógeno fúngico (DC.) f. sp. (), que causa el oídio (PM). En este estudio, se evaluó una colección de 406 accesiones de cebada de EE. UU., Kazajistán, Europa y África en cuanto a su resistencia al PM durante un período de 3 años en el sureste de Kazajistán. La colección se cultivó en el campo en 2020, 2021 y 2022 y se genotipó utilizando el chip SNP Illumina de 9K. Se realizó un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS) para identificar los loci de rasgos cuantitativos (QTL) asociados con la resistencia al PM. Como resultado, se detectaron siete QTL para la resistencia al PM en los cromosomas 4H, 5H y 7H (valores FDR < 0.05). Las posiciones genéticas de dos QTL fueron similares a las de los QTL de resistencia al PM reportados previamente en la literatura científica, lo que sugiere que los cinco QTL restantes son nuevos factores genéticos putativos para el rasgo estudiado. El análisis de haplotipos para siete QTL reveló tres haplotipos que estaban asociados con la resistencia total al PM y un haplotipo asociado con la alta severidad del PM en la colección de cebada. Los QTL e haplotipos identificados asociados con la resistencia al PM de la cebada pueden ser utilizados para análisis adicionales, apilamiento de rasgos y selección asistida por marcadores.