El tamaño del cuerpo es un indicador de crecimiento importante en los patos y es un criterio de selección primordial para la mejora física. Una tasa de crecimiento excesivamente rápida en los patos de carne puede resultar en un tamaño corporal excesivo, lo que puede obstaculizar las operaciones de procesamiento y sacrificio posteriores. Sin embargo, solo se han estudiado algunos marcadores moleculares relacionados con el tamaño corporal en los patos de carne. En este estudio, realizamos un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS) para identificar genes candidatos y QTLs que afectan la longitud del cuerpo (BL), la longitud del hueso del quilla (KBL), la longitud del cuello (NL) y el ancho del pecho (BrW) en patos Pekín (Anas platyrhynchos domestica). Nuestros resultados indican que el SNP significativo para NL se encuentra dentro de un pseudogén, mientras que el SNP significativo para BrW se localiza en una región intergénica. Más importante aún, nuestro análisis identificó un haplotipo que estaba significativamente asociado tanto con BL como con KBL. Este haplotipo, que contiene 48 polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs), está localizado dentro del gen. La identificación de este haplotipo sugiere que puede ser un gen candidato clave que influye en BL y KBL en los patos Pekín. Estos hallazgos tienen importantes implicaciones para la cría y mejora genética de los patos Pekín, y proporcionan valiosos conocimientos sobre la arquitectura genética de los rasgos de tamaño corporal en esta especie.