El color de pelaje ruano se describe como la dispersión de pelos blancos dentro de un pelaje de color sólido. Este fenotipo se expresa principalmente en el cuerpo del caballo, mientras que la cabeza y las patas presentan pocos o ningún pelo blanco. Estudios anteriores mapearon el locus para el ruano en la región y observaron variantes vinculadas en un pequeño número de razas. Sin embargo, utilizar esos marcadores vinculados para determinar el genotipo ruano en otras razas ha tenido un éxito limitado. En esta comunicación, identificamos un segundo alelo ruano (RN2) que, junto con un alelo ruano previamente observado (RN1), representa aproximadamente el 74%, o 188 caballos, de una muestra total de 257 caballos ruanos. Dentro de la población no ruana (N = 3212), estos alelos estaban presentes en menos del 1% del total, principalmente en caballos con colores de pelaje claros debido a variantes de dilución. Se requiere trabajo futuro para identificar alelos adicionales responsables de fenotipos de color de pelaje de caballo tipo ruano.