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Identificación de Genes Candidatos y Vías Funcionales Asociadas con Rasgos de Tamaño Corporal en Ganado Holstein Chino Basada en Análisis GWAS

Autores: Abdalla, Ismail Mohamed; Hui, Jiang; Nazar, Mudasir; Arbab, Abdelaziz Adam Idriss; Xu, Tianle; Abdu, Shaima Mohamed Nasr; Mao, Yongjiang; Yang, Zhangping; Lu, Xubin

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación de Genes Candidatos y Vías Funcionales Asociadas con Rasgos de Tamaño Corporal en Ganado Holstein Chino Basada en Análisis GWAS


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Tamaño corporal
Variantes genéticas
Estudios de asociación a nivel genómico
Genes
Polimorfismos de un solo nucleótido
Selección genómica

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El tamaño corporal es uno de los rasgos económicamente más importantes del ganado lechero, ya que está significativamente asociado con la longevidad de las vacas, la producción, la salud, la fertilidad y la adaptación ambiental. La identificación y aplicación de variantes genéticas utilizando un enfoque genético novedoso, como los estudios de asociación a nivel genómico (GWAS), puede proporcionar más información sobre la arquitectura genética de rasgos complejos. La identificación de genes, polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) y vías asociadas con los rasgos de tamaño corporal puede contribuir a la selección genómica y a la planificación a largo plazo para la selección en vacas lecheras. En este estudio, realizamos un análisis GWAS para identificar los marcadores genéticos y genes asociados con cuatro rasgos de tamaño corporal (altura corporal, profundidad corporal, ancho del pecho y angularidad) en 1000 vacas Holstein chinas. Realizamos la genotipificación de SNP en 1000 individuos, basándonos en el GeneSeek Genomic Profiler Bovine 100 K. En total, identificamos 11 SNP significativos en asociación con los rasgos de tamaño corporal en el umbral de corrección de Bonferroni (5.90 x 10) utilizando el modelo de unificación de probabilidad de circulación de modelo fijo y aleatorio (FarmCPU). Varios genes dentro de distancias de 200 kb (aguas arriba o aguas abajo) de los SNP significativos fueron identificados como genes candidatos, incluyendo , , , , , y . Además, los genes dentro de 200 kb de los SNP identificados fueron significativamente enriquecidos.

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