El alojamiento de la soja ( (L.) Merril.) reduce significativamente el rendimiento y la calidad de las semillas, particularmente en entornos de alto rendimiento. Este fenómeno ocurre cuando los tallos se debilitan bajo el peso de las plantas, complicando la cosecha. Este estudio investigó la relación entre la composición química del tallo de soja, las características físicas y la resistencia al alojamiento para mejorar el rendimiento y la resiliencia. Encontramos que a medida que aumentaba la densidad de las plantas, la dureza del tallo disminuía y la elasticidad aumentaba, elevando el riesgo de alojamiento. Por el contrario, la alta temperatura (28 grados C) aumentó el contenido de lignina, celulosa y pectina en las paredes celulares del tallo, mejorando la resistencia al alojamiento. Además, después de excluir las diferencias en las relaciones filogenéticas a través de un análisis de clúster, mapeamos genes estables en el ambiente vinculados a la resistencia al alojamiento e identificamos nuevos QTLs en Chr3 y Chr16. Los genes candidatos asociados con estos QTLs fueron confirmados mediante qRT-PCR y tratamientos hormonales en diversas variedades de soja. Se encontró que la expresión de los genes de la punta del tallo estaba estrechamente relacionada con el diámetro del nodo del tallo. Estos hallazgos proporcionan una base teórica para la cría de variedades de soja de alto rendimiento con mejor resistencia al alojamiento y avanzan en los esfuerzos para desarrollar cultivares de soja resilientes.