Identificación de Genes Conductores y miARN en Cáncer de Ovario a través de un Enfoque Integrado In-Silico
Autores: Beg, Anam; Parveen, Rafat; Fouad, Hassan; Yahia, M. E.; Hassanein, Azza S.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación de Genes Conductores y miARN en Cáncer de Ovario a través de un Enfoque Integrado In-Silico
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Cáncer de ovario
MiARNs
Pronóstico
Conjunto de datos de microarreglos
Genes clave
DEG
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 17
Citaciones: Sin citaciones
El cáncer de ovario es el octavo cáncer más común en mujeres y tiene la tasa de mortalidad más alta entre todas las malignidades ginecológicas en el mundo occidental. La evidencia creciente muestra que los miARN están relacionados con la progresión del cáncer de ovario. En el estudio actual, nos enfocamos en la identificación de miARN y sus genes asociados que son responsables del pronóstico temprano de pacientes con cáncer de ovario. El conjunto de datos de microarreglos GSE119055 utilizado en este estudio fue recuperado a través de la base de datos GEO disponible públicamente por NCBI para el análisis de DEGs. El conjunto de datos de miARN GSE119055 incluye seis muestras de carcinoma de ovario junto con tres muestras sanas/primarias. En nuestro estudio, se realizó un análisis de DEM de carcinoma de ovario y sujetos sanos utilizando R Software para transformar y normalizar todos los datos transcriptómicos junto con paquetes de Bioconductor. Resultados: Identificamos miARN y sus genes centrales asociados de las muestras de cáncer de ovario. Descubrimos los cinco miARN más regulados al alza (hsa-miR-130b-3p, hsa-miR-18a-5p, hsa-miR-182-5p, hsa-miR-187-3p y hsa-miR-378a-3p) y los cinco miARN más regulados a la baja (hsa-miR-501-3p, hsa-miR-4324, hsa-miR-500a-3p, hsa-miR-1271-5p y hsa-miR-660-5p) de la red y sus genes asociados, que incluyen siete genes comunes (SCN2A, BCL2, MAF, ZNF532, CADM1, ELAVL2 y ESRRG) que fueron considerados genes centrales para la red regulada a la baja. De manera similar, para los miARN regulados al alza encontramos dos genes centrales (PRKACB y TAOK1).
Descripción
El cáncer de ovario es el octavo cáncer más común en mujeres y tiene la tasa de mortalidad más alta entre todas las malignidades ginecológicas en el mundo occidental. La evidencia creciente muestra que los miARN están relacionados con la progresión del cáncer de ovario. En el estudio actual, nos enfocamos en la identificación de miARN y sus genes asociados que son responsables del pronóstico temprano de pacientes con cáncer de ovario. El conjunto de datos de microarreglos GSE119055 utilizado en este estudio fue recuperado a través de la base de datos GEO disponible públicamente por NCBI para el análisis de DEGs. El conjunto de datos de miARN GSE119055 incluye seis muestras de carcinoma de ovario junto con tres muestras sanas/primarias. En nuestro estudio, se realizó un análisis de DEM de carcinoma de ovario y sujetos sanos utilizando R Software para transformar y normalizar todos los datos transcriptómicos junto con paquetes de Bioconductor. Resultados: Identificamos miARN y sus genes centrales asociados de las muestras de cáncer de ovario. Descubrimos los cinco miARN más regulados al alza (hsa-miR-130b-3p, hsa-miR-18a-5p, hsa-miR-182-5p, hsa-miR-187-3p y hsa-miR-378a-3p) y los cinco miARN más regulados a la baja (hsa-miR-501-3p, hsa-miR-4324, hsa-miR-500a-3p, hsa-miR-1271-5p y hsa-miR-660-5p) de la red y sus genes asociados, que incluyen siete genes comunes (SCN2A, BCL2, MAF, ZNF532, CADM1, ELAVL2 y ESRRG) que fueron considerados genes centrales para la red regulada a la baja. De manera similar, para los miARN regulados al alza encontramos dos genes centrales (PRKACB y TAOK1).