El desequilibrio a largo plazo entre la fatiga y la recuperación puede eventualmente llevar a debilidad muscular o incluso atrofia. Anteriormente informamos que el ejercicio excesivo induce hipertrofia cardíaca patológica. Sin embargo, el efecto del ejercicio excesivo en los músculos esqueléticos sigue siendo incierto. En el presente estudio, establecimos con éxito un modelo de atrofia muscular esquelética inducida por ejercicio excesivo en peces cebra, con disminución del tamaño de las fibras musculares, velocidad crítica de nado y consumo máximo de oxígeno. El análisis de RNA-seq de alto rendimiento identificó genes expresados diferencialmente en el sistema modelo en comparación con los peces cebra de control. El análisis de ontología genética y enriquecimiento de KEGG reveló que los genes regulados al alza estaban enriquecidos en autofagia, homeostasis, ritmo circadiano, respuesta al estrés oxidativo, apoptosis, la vía de señalización p53 y la vía de señalización FoxO. El análisis de la red de interacción proteína-proteína identificó varios genes clave, incluidos keap1b, per3, ulk1b, socs2, esrp1, bcl2l1, hsp70, igf2r, mdm2, rab18a, col1a1a, fn1a, ppih, tpx2, uba5, nhlrc2, mcm4, tac1, b3gat3 y ddost, que se correlacionan con la patogénesis de la atrofia muscular esquelética inducida por ejercicio excesivo. Las vías regulatorias subyacentes y los genes relacionados con la respuesta a la presión muscular identificados en el presente estudio proporcionarán valiosas ideas para prescribir programas de ejercicio seguros y precisos para atletas y la supervisión y tratamiento clínico de la atrofia muscular inducida por ejercicio excesivo.