Con el crecimiento interminable de la población y el desarrollo de la economía y los estándares de vida, un alto rendimiento con buena calidad de grano se ha convertido en el principal objetivo de la cría. Sin embargo, el encamado es un factor importante que conduce a una disminución significativa en la producción y calidad del arroz (L.). Realizamos un análisis de asociación a nivel genómico para detectar loci de rasgos cuantitativos (QTL) relacionados con la resistencia al encamado, utilizando 395 accesiones templadas. Se detectaron un total de 50 QTL que afectan a los seis rasgos, utilizando 1,438,279 marcadores de polimorfismos de un solo nucleótido de alta calidad. Se detectaron cinco grupos importantes de QTL que afectan a los rasgos relacionados con la resistencia al encamado. Se detectaron diez genes candidatos mediante análisis de expresión génica diferencial y análisis de haplotipos. Entre ellos, () para , y , () para y y () para y fueron considerados los genes candidatos más probables en base a las anotaciones funcionales. Los resultados pueden facilitar la cría de variedades de arroz resistentes al encamado, para superar los efectos adversos del cambio climático.