Estudio de Asociación a Nivel Genómico e Identificación de Genes Candidatos para la Composición de Ácidos Grasos de Grasa Intramuscular en Cerdos Ningxiang
Autores: Zeng, Qinghua; Gao, Hu; Yin, Shishu; Peng, Yinglin; Yang, Fang; Fu, Yawei; Deng, Xiaoxiao; Chen, Yue; Hou, Xiaohong; Wang, Qian; Jin, Zhao; Song, Gang; He, Jun; Yin, Yulong; Xu, Kang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Estudio de Asociación a Nivel Genómico e Identificación de Genes Candidatos para la Composición de Ácidos Grasos de Grasa Intramuscular en Cerdos Ningxiang
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
ácidos grasos
Estudio de asociación a nivel genómico
Polimorfismos de un solo nucleótido
Genes candidatos
ácidos grasos saturados
ácidos grasos poliinsaturados
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Los cerdos Ningxiang exhiben una diversa gama de ácidos grasos, lo que los convierte en un modelo intrigante para explorar las bases genéticas del metabolismo de los ácidos grasos. Realizamos un estudio de asociación a nivel genómico utilizando un conjunto de datos que comprende 50,697 polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) y muestras de más de 600 cerdos Ningxiang. Nuestra investigación arrojó nuevos genes candidatos vinculados a cinco ácidos grasos saturados (AGS), cuatro ácidos grasos monoinsaturados (AGM) y cinco ácidos grasos poliinsaturados (AGP). Se encontraron asociaciones significativas con AGS, AGM y AGP para 37, 21 y 16 SNPs, respectivamente. Notablemente, algunos SNPs tienen un PVE significativo, como ALGA0047587, que puede explicar el 89.85% de la variación en el ácido araquídico (C20:0); H3GA0046208 y DRGA0016063 pueden explicar un total del 76.76% de la variación en el ácido elaídico (C18:1n-9(t)), y el SNP significativo ALGA0031262 del ácido araquidónico (C20:4n-6) puede explicar el 31.76% de la variación. Varios SNPs significativos se posicionaron proximales a genes reportados previamente. En total, identificamos 11 genes candidatos, seis genes candidatos y cinco genes candidatos asociados con AGS, AGM y AGP, respectivamente. Estos hallazgos tienen un gran potencial para avanzar en estrategias de cría destinadas a optimizar la calidad de la carne y mejorar el metabolismo lipídico dentro de la grasa intramuscular (IMF) de los cerdos Ningxiang.
Descripción
Los cerdos Ningxiang exhiben una diversa gama de ácidos grasos, lo que los convierte en un modelo intrigante para explorar las bases genéticas del metabolismo de los ácidos grasos. Realizamos un estudio de asociación a nivel genómico utilizando un conjunto de datos que comprende 50,697 polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) y muestras de más de 600 cerdos Ningxiang. Nuestra investigación arrojó nuevos genes candidatos vinculados a cinco ácidos grasos saturados (AGS), cuatro ácidos grasos monoinsaturados (AGM) y cinco ácidos grasos poliinsaturados (AGP). Se encontraron asociaciones significativas con AGS, AGM y AGP para 37, 21 y 16 SNPs, respectivamente. Notablemente, algunos SNPs tienen un PVE significativo, como ALGA0047587, que puede explicar el 89.85% de la variación en el ácido araquídico (C20:0); H3GA0046208 y DRGA0016063 pueden explicar un total del 76.76% de la variación en el ácido elaídico (C18:1n-9(t)), y el SNP significativo ALGA0031262 del ácido araquidónico (C20:4n-6) puede explicar el 31.76% de la variación. Varios SNPs significativos se posicionaron proximales a genes reportados previamente. En total, identificamos 11 genes candidatos, seis genes candidatos y cinco genes candidatos asociados con AGS, AGM y AGP, respectivamente. Estos hallazgos tienen un gran potencial para avanzar en estrategias de cría destinadas a optimizar la calidad de la carne y mejorar el metabolismo lipídico dentro de la grasa intramuscular (IMF) de los cerdos Ningxiang.