El número de vértebras es un rasgo económico crucial que puede impactar significativamente la longitud de la canal y la producción de carne en los animales. Sin embargo, nuestra comprensión de los loci de rasgos cuantitativos (QTL) y los genes candidatos asociados con el número vertebral en ovejas sigue siendo limitada. Para identificar estos genes candidatos y QTL, recolectamos 73 ovejas Ujimqin con un número aumentado de vértebras (T13L7, T14L6 y T14L7) y 23 ovejas con un número normal de vértebras (T13L6). A través de la resecuenciación del genoma de alto rendimiento, obtuvimos un total de 24,130,801 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) efectivos. Al realizar un análisis de barrido selectivo, descubrimos que la región más significativamente selectiva estaba ubicada en el cromosoma 7. Dentro de esta región, identificamos varios genes, incluidos , , , y , conocidos por regular el desarrollo y la morfología espinal. Además, un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS) realizado en ovejas con números vertebrales aumentados y normales confirmó que es un gen candidato para determinar el número de vértebras en ovejas. Adicionalmente, el SNP más significativo en el cromosoma 7 fue identificado como un QTL candidato. Además, detectamos dos mutaciones missense en el gen; una de estas mutaciones (Chr7: 89393414, C > T) en la posición 22 conduce a la conversión de arginina (Arg) a glutamina (Gln), lo que se espera que afecte negativamente la función de la proteína. Notablemente, un perfil de expresión del transcriptoma en el desarrollo embrionario de ratón reveló que se expresa en alta cantidad durante el período crítico de formación vertebral (4.5-7.5 días). Nuestro estudio destaca como un posible gen mayor que influye en el número de vértebras en ovejas Ujimqin, con perspectivas prometedoras para futuras mejoras en la cría asistida por genoma en ovejas.