Identificación sistemática de genes de referencia adecuados para el análisis de PCR cuantitativa en tiempo real en L
Autores: Bharati, Rohit; Sen, Madhab Kumar; Kumar, Ram; Gupta, Aayushi; iarovská, Jana; Fernández-Cusimamani, Eloy; Leuner, Olga
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación sistemática de genes de referencia adecuados para el análisis de PCR cuantitativa en tiempo real en L
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Limón
Propiedades farmacológicas
Expresión génica
Gen de referencia
Estrés abiótico
Metabolitos secundarios
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
L. es bien conocido por su aroma a limón y sus diversas propiedades farmacológicas. A pesar de estas valiosas propiedades, los genes involucrados en las vías biosintéticas en no están aún bien explorados en comparación con otros miembros de la familia de las mentas. Para ello, los estudios de expresión génica utilizando PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) son una excelente herramienta. Aunque la qRT-PCR puede proporcionar resultados precisos, su exactitud depende en gran medida de la expresión y estabilidad del gen de referencia utilizado para la normalización. Por lo tanto, seleccionar un gen de referencia específico para el experimento es crucial para obtener resultados precisos. Sin embargo, hasta la fecha, no hay informes sobre genes de referencia específicos para el experimento en . Por lo tanto, en el presente estudio, se evaluaron diez genes de referencia comúnmente utilizados por su idoneidad como genes de referencia óptimos en bajo diversas condiciones de estrés abiótico y diferentes órganos de la planta. Los genes candidatos fueron clasificados en función de BestKeeper, Ct comparativo, geNorm, NormFinder y RefFinder. Basado en los resultados, recomendamos la combinación de y como los mejores genes de referencia para normalizar los estudios de expresión génica en . Por el contrario, se identificó como el gen de menor rendimiento. Posteriormente, se evaluó la fiabilidad de la combinación óptima de genes al evaluar la expresión relativa del gen () bajo dos tratamientos con elicitores (ácido giberélico y ácido jasmonico). es un gen crucial involucrado directa o indirectamente en la producción de varios metabolitos secundarios económicamente importantes en las plantas. También se discuten los genes de referencia adecuados para cada condición experimental. Los hallazgos del presente estudio forman una base para los estudios actuales y futuros de expresión génica en y otras especies relacionadas.
Descripción
L. es bien conocido por su aroma a limón y sus diversas propiedades farmacológicas. A pesar de estas valiosas propiedades, los genes involucrados en las vías biosintéticas en no están aún bien explorados en comparación con otros miembros de la familia de las mentas. Para ello, los estudios de expresión génica utilizando PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) son una excelente herramienta. Aunque la qRT-PCR puede proporcionar resultados precisos, su exactitud depende en gran medida de la expresión y estabilidad del gen de referencia utilizado para la normalización. Por lo tanto, seleccionar un gen de referencia específico para el experimento es crucial para obtener resultados precisos. Sin embargo, hasta la fecha, no hay informes sobre genes de referencia específicos para el experimento en . Por lo tanto, en el presente estudio, se evaluaron diez genes de referencia comúnmente utilizados por su idoneidad como genes de referencia óptimos en bajo diversas condiciones de estrés abiótico y diferentes órganos de la planta. Los genes candidatos fueron clasificados en función de BestKeeper, Ct comparativo, geNorm, NormFinder y RefFinder. Basado en los resultados, recomendamos la combinación de y como los mejores genes de referencia para normalizar los estudios de expresión génica en . Por el contrario, se identificó como el gen de menor rendimiento. Posteriormente, se evaluó la fiabilidad de la combinación óptima de genes al evaluar la expresión relativa del gen () bajo dos tratamientos con elicitores (ácido giberélico y ácido jasmonico). es un gen crucial involucrado directa o indirectamente en la producción de varios metabolitos secundarios económicamente importantes en las plantas. También se discuten los genes de referencia adecuados para cada condición experimental. Los hallazgos del presente estudio forman una base para los estudios actuales y futuros de expresión génica en y otras especies relacionadas.