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Identificación basada en transcriptoma de los genes de referencia óptimos para análisis de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real cuantitativa de los frutos de arándano rojo a lo largo del ciclo de crecimiento

Autores: Zhang, Wanchen; Xu, Jian; Wang, Qiang; Li, Jing; Li, Yadong; Dong, Mei; Sun, Haiyue

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación basada en transcriptoma de los genes de referencia óptimos para análisis de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real cuantitativa de los frutos de arándano rojo a lo largo del ciclo de crecimiento


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Nutricionalmente
Económicamente
Especies de plantas silvestres
Análisis de expresión génica
Estrés abiótico
Genes de referencia

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
(1) Antecedentes: es una especie de planta silvestre natural valiosa desde el punto de vista nutricional y económico que produce bayas útiles para tratar diversas enfermedades. Hay un creciente interés en el arándano rojo, pero hay información limitada sobre los genes de referencia del arándano rojo adecuados para análisis de expresión génica de diferentes tejidos bajo diversas condiciones de estrés abiótico. El objetivo de este estudio fue identificar genes de referencia estables adecuados para diferentes tejidos de arándano rojo en respuesta al estrés abiótico. (2) Métodos: Se utilizaron el método delta Ct y los programas GeNorm v3.5 y NormFinder v20 para analizar de manera integral la estabilidad de la expresión génica. (3) Resultados: fue el mejor gen de referencia para analizar diferentes cultivares, mientras que fue el gen de referencia más adecuado para analizar diferentes tejidos y estrés alcalino. En contraste, fue el gen de referencia más estable en condiciones de sequía. (4) Conclusiones: Estos genes de referencia adecuados pueden ser utilizados en futuros análisis de qRT-PCR de diferentes tejidos de arándano rojo y los efectos de los estreses abióticos. Además, los datos del estudio pueden ser útiles para estudios de genómica funcional y la mejora molecular del arándano rojo. En resumen, los genes de referencia internos o las combinaciones de genes de referencia internos deben seleccionarse cuidadosamente de acuerdo con las condiciones experimentales para garantizar que los datos de expresión génica generados sean precisos.

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