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Cribado y verificación de genes de referencia para el análisis de la expresión génica en ajo (L.) bajo estrés por frío y sequía

Autores: Wang, Qizhang; Guo, Chunqian; Yang, Shipeng; Zhong, Qiwen; Tian, Jie

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Cribado y verificación de genes de referencia para el análisis de la expresión génica en ajo (L.) bajo estrés por frío y sequía


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Estudio
Genes de referencia
Expresión génica
Condiciones de crecimiento
Estrés
Abundancia de transcritos

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 6

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El objetivo principal de este estudio fue seleccionar y verificar genes de referencia apropiados para la evaluación de la expresión génica durante el crecimiento y desarrollo de las plantas bajo distintas condiciones de crecimiento. Nueve genes de referencia candidatos fueron seleccionados basándose en datos de secuencias del transcriptoma de ajo. Se utilizó RT-qPCR para detectar los niveles de expresión de los genes de referencia mencionados en tejidos específicos bajo estrés por sequía y frío. Luego, se utilizaron geNorm, NormFinder, BestKeeper y ReFinder para considerar la consistencia de los niveles de expresión de los genes de referencia candidatos. Finalmente, se evaluó cuantitativamente la expresión génica en respuesta al estrés de la ascorbato peroxidasa para confirmar los genes de referencia elegidos. Nuestros resultados indicaron que había variaciones en la abundancia y estabilidad de los transcritos de nueve genes de referencia bajo estrés por frío y sequía, entre los cuales algunos tenían la mayor abundancia de transcritos, y otros tenían la menor abundancia de transcritos. Algunos fueron los genes más estables expresados en todas las muestras; otros fueron los genes más estables expresados durante el estrés por frío, y otros más durante el estrés por sequía. Los genes más estables expresados en raíces, pseudotallos, hojas y dientes fueron, respectivamente, mientras que uno fue el gen más inestable durante las condiciones de estrés por sequía y frío y en tejidos exclusivos. Tomando los genes de referencia estables como referencias durante el estrés por sequía y frío, se demostró aún más la fiabilidad de los niveles de expresión al detectar la expresión de . Nuestro trabajo ofrece así una referencia teórica para la evaluación de la expresión génica en ajo en varios tejidos y bajo condiciones de estrés.

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