La identificación de genes funcionales que afectan las características de la carne relacionadas con la grasa en palomas de tipo carne utilizando secuenciación de ADN asociada a restricción de doble digestión y análisis de acoplamiento molecular
Autores: Yuan, Siyu; Tian, Shaoqi; Meng, Chuang; Ji, Feng; Zhou, Bin; Rushdi, Hossam E.; Ye, Manhong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
La identificación de genes funcionales que afectan las características de la carne relacionadas con la grasa en palomas de tipo carne utilizando secuenciación de ADN asociada a restricción de doble digestión y análisis de acoplamiento molecular
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Paloma indígena china
Paloma shiqi
Paloma rey blanca
Características de calidad de la carne
Grasa intramuscular
Composiciones de ácidos grasos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La paloma indígena china Shiqi (SQ) y la paloma importada White King (WK) son dos razas de palomas de tipo carne de importancia económica y nutricional en China. Mostraron diferencias significativas en rasgos de calidad de la carne como el contenido de grasa intramuscular (IMF) y las composiciones de ácidos grasos (FA) en los músculos del pecho. En este estudio, nuestro objetivo fue seleccionar genes candidatos que pudieran afectar los rasgos de calidad de la carne relacionados con la grasa en palomas de tipo carne. Investigamos las variaciones polimórficas a nivel genómico utilizando secuenciación de ADN asociada a restricción de doble digestión (ddRAD) en 12 pichones de palomas SQ y WK que exhibieron diferencias interrazas significativas en el contenido de IMF, así como en las composiciones de FA y aminoácidos en los músculos del pecho, y seleccionamos genes candidatos que influyen en rasgos relacionados con la grasa en pichones a través de análisis de ontología genética y análisis de vías. Al centrarnos en 6019 SNPs, que estaban ubicados en genes con anotaciones correctas y tenían el potencial de inducir cambios en las proteínas codificadas, identificamos 19 genes como genes candidatos que podrían afectar los rasgos relacionados con la grasa en pichones. Estaban significativamente enriquecidos en las vías de metabolismo, degradación y biosíntesis de FA. Los resultados del análisis de acoplamiento molecular revelaron además que tres alteraciones de aminoácidos no sinónimos, ACAA1(S357N), ACAA2(T234I) y ACACB(H1418N), podrían alterar las interacciones no covalentes entre las proteínas enzimáticas y sus sustratos. Dado que ACAA1, ACAA2 y ACACB codifican enzimas limitantes de la tasa en la síntesis y degradación de FA, las alteraciones en la afinidad de unión enzima-sustrato pueden afectar posteriormente la eficiencia catalítica de las enzimas. Sugerimos que los SNPs en estos tres genes merecen una investigación adicional sobre sus roles en la explicación de las disparidades en los rasgos relacionados con la grasa en pichones.
Descripción
La paloma indígena china Shiqi (SQ) y la paloma importada White King (WK) son dos razas de palomas de tipo carne de importancia económica y nutricional en China. Mostraron diferencias significativas en rasgos de calidad de la carne como el contenido de grasa intramuscular (IMF) y las composiciones de ácidos grasos (FA) en los músculos del pecho. En este estudio, nuestro objetivo fue seleccionar genes candidatos que pudieran afectar los rasgos de calidad de la carne relacionados con la grasa en palomas de tipo carne. Investigamos las variaciones polimórficas a nivel genómico utilizando secuenciación de ADN asociada a restricción de doble digestión (ddRAD) en 12 pichones de palomas SQ y WK que exhibieron diferencias interrazas significativas en el contenido de IMF, así como en las composiciones de FA y aminoácidos en los músculos del pecho, y seleccionamos genes candidatos que influyen en rasgos relacionados con la grasa en pichones a través de análisis de ontología genética y análisis de vías. Al centrarnos en 6019 SNPs, que estaban ubicados en genes con anotaciones correctas y tenían el potencial de inducir cambios en las proteínas codificadas, identificamos 19 genes como genes candidatos que podrían afectar los rasgos relacionados con la grasa en pichones. Estaban significativamente enriquecidos en las vías de metabolismo, degradación y biosíntesis de FA. Los resultados del análisis de acoplamiento molecular revelaron además que tres alteraciones de aminoácidos no sinónimos, ACAA1(S357N), ACAA2(T234I) y ACACB(H1418N), podrían alterar las interacciones no covalentes entre las proteínas enzimáticas y sus sustratos. Dado que ACAA1, ACAA2 y ACACB codifican enzimas limitantes de la tasa en la síntesis y degradación de FA, las alteraciones en la afinidad de unión enzima-sustrato pueden afectar posteriormente la eficiencia catalítica de las enzimas. Sugerimos que los SNPs en estos tres genes merecen una investigación adicional sobre sus roles en la explicación de las disparidades en los rasgos relacionados con la grasa en pichones.