Identificación de Genes Clave Potenciales Relacionados con Aflatoxina B1, Fibrosis Hepática y Carcinoma Hepatocelular a través de un Análisis Bioinformático Integrado
Autores: Hamdy, Hayam; Yang, Yi; Cheng, Cheng; Liu, Qizhan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación de Genes Clave Potenciales Relacionados con Aflatoxina B1, Fibrosis Hepática y Carcinoma Hepatocelular a través de un Análisis Bioinformático Integrado
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Mecanismo molecular
Hepatotóxico
Aflatoxina B1
Fibrosis hepática
Carcinoma hepatocelular
Genes clave
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 18
Citaciones: Sin citaciones
El mecanismo molecular del hepatotóxico aflatoxina B1 para inducir fibrosis hepática y carcinoma hepatocelular (CHC) sigue sin estar claro, para ofrecer nuevas perspectivas sobre los mecanismos moleculares subyacentes al inicio y la progresión de la fibrosis-CHC asociada a AFB1, que pueden ofrecer nuevos objetivos para la detección y terapia del CHC causado por AFB1. En este estudio, se descargaron perfiles de expresión de conjuntos de datos relacionados con AFB1, fibrosis hepática y cáncer de hígado del Gene Expression Omnibus (GEO), y se identificaron genes expresados diferencialmente (GEDs) mediante la herramienta GEO2R. Se utilizaron la base de datos STRING, CytoHubba y el software Cytoscape para crear la interacción proteína-proteína y los genes centrales de los genes combinados, y se identificaron la puntuación ssGSEA para conjuntos de genes relacionados con células inflamatorias, la vía de señalización y la inmunoterapia utilizando el software R y la base de datos GSEA. Los hallazgos revelaron que los genes combinados asociados a la fibrosis hepática y CHC por AFB1 estaban vinculados a interrupciones en los procesos celulares, se identificaron los genes BUB1B y RRM2 como genes centrales, y el gen BUB1B se incrementó significativamente en las vías de conjuntos de genes de señalización JAK-STAT, así como tener un impacto relacionado con la inmunoterapia. En conclusión, BUB1B y RRM2 fueron identificados como biomarcadores potenciales para la fibrosis inducida por AFB1 y la progresión del CHC.
Descripción
El mecanismo molecular del hepatotóxico aflatoxina B1 para inducir fibrosis hepática y carcinoma hepatocelular (CHC) sigue sin estar claro, para ofrecer nuevas perspectivas sobre los mecanismos moleculares subyacentes al inicio y la progresión de la fibrosis-CHC asociada a AFB1, que pueden ofrecer nuevos objetivos para la detección y terapia del CHC causado por AFB1. En este estudio, se descargaron perfiles de expresión de conjuntos de datos relacionados con AFB1, fibrosis hepática y cáncer de hígado del Gene Expression Omnibus (GEO), y se identificaron genes expresados diferencialmente (GEDs) mediante la herramienta GEO2R. Se utilizaron la base de datos STRING, CytoHubba y el software Cytoscape para crear la interacción proteína-proteína y los genes centrales de los genes combinados, y se identificaron la puntuación ssGSEA para conjuntos de genes relacionados con células inflamatorias, la vía de señalización y la inmunoterapia utilizando el software R y la base de datos GSEA. Los hallazgos revelaron que los genes combinados asociados a la fibrosis hepática y CHC por AFB1 estaban vinculados a interrupciones en los procesos celulares, se identificaron los genes BUB1B y RRM2 como genes centrales, y el gen BUB1B se incrementó significativamente en las vías de conjuntos de genes de señalización JAK-STAT, así como tener un impacto relacionado con la inmunoterapia. En conclusión, BUB1B y RRM2 fueron identificados como biomarcadores potenciales para la fibrosis inducida por AFB1 y la progresión del CHC.