El color de la carne es uno de los rasgos económicos más importantes en las gallinas. Sin embargo, la red genética y los mecanismos regulatorios que contribuyen a los rasgos de color de la carne en las gallinas siguen siendo en gran medida desconocidos. En el presente estudio, realizamos un análisis de red de coexpresión genética ponderada (WGCNA) basado en conjuntos de datos de RNA-Seq de 16 muestras de músculo pectoral mayor de dos razas de gallinas de plumas amarillas para identificar los módulos y genes clave relacionados con el color de la carne en las gallinas. Se utilizaron un total de 18,821 genes para construir la red de coexpresión genética ponderada, y se identificaron 29 módulos de coexpresión genética. Entre estos módulos, se encontraron cinco módulos, incluidos los módulos azul, marrón, azul acero, turquesa pálido y naranja, que estaban significativamente correlacionados con los rasgos de color de la carne. Además, se identificaron varios genes dentro del módulo de asociación involucrados en la regulación de la actividad mitocondrial (por ejemplo, ATP5L, UQCR10 y COX7C) y la oxidación de lípidos (por ejemplo, CAV3, RBP4A y APOH) como genes clave que pueden desempeñar un papel crucial en la regulación del color de la carne. Estos resultados proporcionan información valiosa para mejorar nuestra comprensión de la expresión y regulación genética en relación con los rasgos de color de la carne y contribuyen a futuros programas de cría molecular para mejorar el color de la carne en las gallinas.