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Análisis de asociación del transcriptoma y proteoma para seleccionar genes candidatos relacionados con la tolerancia a la sal en hojas bajo estrés salino

Autores: Liu, Hanghang; Chong, Peifang; Yan, Shipeng; Liu, Zehua; Bao, Xinguang; Tan, Bingbing

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Análisis de asociación del transcriptoma y proteoma para seleccionar genes candidatos relacionados con la tolerancia a la sal en hojas bajo estrés salino


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Mecanismos moleculares
Estrés salino
Secuenciación de ARN
Genes expresados diferencialmente
Proteínas expresadas diferencialmente
Tolerancia a la sal

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 9

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Este trabajo tiene como objetivo estudiar los mecanismos moleculares subyacentes a la respuesta al estrés salino. Utilizamos técnicas de secuenciación de ARN (RNA-Seq) y etiquetas de masa en tándem (TMT) para identificar genes expresados diferencialmente (DEGs) y proteínas expresadas diferencialmente (DEPs) en hojas tratadas con 0, 200 y 500 mM de NaCl durante 72 h. Los resultados indicaron que, en comparación con el grupo de tratamiento de 0 mM de NaCl, se identificaron 2391 y 6400 DEGs en los grupos de tratamiento de 200 y 500 mM de NaCl, respectivamente, mientras que también se identificaron 47 y 177 DEPs. Se realizó un análisis de asociación entre el transcriptoma y el proteoma en las hojas del grupo de tratamiento de 0/500 mM de NaCl, y se identificaron 32 genes con tendencias de expresión de ARNm y proteínas consistentes. Genes diferenciales como , , , , , , y otros están involucrados en la fotosíntesis, el transporte de vesículas, el transporte de auxinas y otras funciones de las plantas, y podrían desempeñar un papel clave en la tolerancia a la sal de . En este estudio, se utilizaron técnicas de asociación entre el transcriptoma y el proteoma para seleccionar genes candidatos asociados con la tolerancia a la sal en , lo que proporciona una base teórica importante para comprender el mecanismo molecular de la tolerancia a la sal en y para la cría de recursos genéticos de alta calidad.

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