El algodón (spp.) es una importante fuente de fibra natural y un cultivo de gran valor. El hábito de crecimiento y la arquitectura del algodón determinan su productividad e influyen en las estrategias de manejo para la producción comercial. Los factores de transcripción GATA (TFs) controlan varios procesos de desarrollo en las plantas, como el desarrollo de flores, brácteas y embriones, y la diferenciación de pétalos. Dado que la transformación estable sigue siendo un cuello de botella en muchas especies de plantas, se utilizó TRV-VIGS para manipular la expresión génica en diferentes plantas, incluida L. En este estudio, llevamos a cabo el VIGS basado en TRV para caracterizar funcionalmente dos genes candidatos, y , identificados a través del análisis de eQTL de cinco genes de inducción floral e identidad de meristemos utilizando la colección mini-core de algodón de secano. El silenciamiento inducido por virus del gen resultó en una reducción de hasta 1,4 veces en el nivel de transcripción en dos plantas inoculadas, G3 y G4, y el gen resultó en una reducción de hasta 2,3 veces en el nivel de transcripción en una planta inoculada P05 en comparación con la planta tratada con placebo. Las plantas inoculadas con TRV2-- G3 y G4 también mostraron la pérdida de la bráctea floral supernumeraria (cuarta) en las cápsulas, mientras que las plantas inoculadas con TRV2-- no mostraron ningún cambio fenotípico observable en comparación con las plantas tratadas con placebo. En conjunto, este estudio sugiere que TRV-VIGS se puede utilizar para caracterizar genes en algodón de manera relativamente rápida, y el gen del algodón es un regulador positivo del hábito de crecimiento indeterminado en el algodón, que podría ser manipulado para obtener una planta de algodón con una arquitectura mejor adaptada para la zona de cultivo.