La identificación de un gen relacionado con el rendimiento que controla múltiples rasgos utilizando GWAS en sorgo (L.)
Autores: Zhang, Yizhong; Fan, Xinqi; Liang, Du; Guo, Qi; Zhang, Xiaojuan; Nie, Mengen; Li, Chunhong; Meng, Shan; Zhang, Xianggui; Xu, Peng; Guo, Wenqi; Wang, Huiyan; Liu, Qingshan; Wu, Yuxiang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
La identificación de un gen relacionado con el rendimiento que controla múltiples rasgos utilizando GWAS en sorgo (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Sorgo
Diversidad genética
Rasgos
SNPs
QTLs
Mejoramiento
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
(L.) es uno de los cultivos más antiguos cultivados por los seres humanos, que se ha utilizado en la alimentación y la elaboración de vino. Para entender la diversidad genética de los recursos de mejora del sorgo y guiar aún más la mejora asistida por marcadores moleculares, se analizaron seis rasgos relacionados con el rendimiento de 214 germoplasmas de sorgo de todo el mundo, y se produjeron 2,811,016 marcadores de polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) mediante la resecuenciación de estos germoplasmas. Después de controlar Q y K, se encontraron QTLs relacionados con los rasgos utilizando tres algoritmos. Curiosamente, se encontró un QTL importante que puede afectar múltiples rasgos en este estudio. Era el candidato más probable para el gen, que era un homólogo del gen encontrado al analizar la anotación del gen en el bloque LD. El análisis de haplotipos mostró que el haplotipo era el haplotipo élite, y solo existía en germoplasmas chinos. Se demostró que los rasgos estaban más asociados con los SNPs del promotor a través de estudios de asociación genética. En general, los QTLs y los genes identificados en este estudio beneficiarían la mejora del rendimiento asistida por marcadores moleculares en el sorgo.
Descripción
(L.) es uno de los cultivos más antiguos cultivados por los seres humanos, que se ha utilizado en la alimentación y la elaboración de vino. Para entender la diversidad genética de los recursos de mejora del sorgo y guiar aún más la mejora asistida por marcadores moleculares, se analizaron seis rasgos relacionados con el rendimiento de 214 germoplasmas de sorgo de todo el mundo, y se produjeron 2,811,016 marcadores de polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) mediante la resecuenciación de estos germoplasmas. Después de controlar Q y K, se encontraron QTLs relacionados con los rasgos utilizando tres algoritmos. Curiosamente, se encontró un QTL importante que puede afectar múltiples rasgos en este estudio. Era el candidato más probable para el gen, que era un homólogo del gen encontrado al analizar la anotación del gen en el bloque LD. El análisis de haplotipos mostró que el haplotipo era el haplotipo élite, y solo existía en germoplasmas chinos. Se demostró que los rasgos estaban más asociados con los SNPs del promotor a través de estudios de asociación genética. En general, los QTLs y los genes identificados en este estudio beneficiarían la mejora del rendimiento asistida por marcadores moleculares en el sorgo.