Identificación y caracterización a nivel genómico de factores de transcripción de pentacisteína básica en
Autores: Hu, Huan; Jiang, Yuqin; Liu, Chiyuan; Zhang, Ying; Chen, Mingxun; Liu, Zijin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación y caracterización a nivel genómico de factores de transcripción de pentacisteína básica en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Cebada
Bbr/bpc
Factor de transcripción
Procesos de desarrollo
Estrés abiótico
Genes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
BARLEY B-RECOMBINANT/BASIC PENTACYSTEINE (BBR/BPC), una familia de factores de transcripción específicos de plantas, es un grupo de factores de unión al motivo GAGA que controlan múltiples procesos de desarrollo del crecimiento y respuesta a estrés abiótico. Los BPC reclutan factores de remodelación de histonas para la represión transcripcional de los objetivos aguas abajo. Sin embargo, la información sobre los BnaBPCs sigue siendo poco clara. Aquí, identificamos 25 genes que se localizan principalmente en el núcleo, se localizan aleatoriamente en 16 cromosomas y se agrupan en tres subfamilias basadas en un análisis filogenético. Veinticinco genes exhiben relaciones sinténicas con otros genes, y los polipéptidos codificados por genes dentro de la misma subfamilia comparten motivos conservados y dominios proteicos similares. La expansión de los genes pasó por eventos de duplicación del genoma completo y selección purificadora en los genomas, y todos los genes tenían los mismos dominios de unión GAGA conservados. Además, el promotor de cada gen consistía en varios elementos asociados con estrés, fitohormonas y crecimiento y desarrollo. Notablemente, el elemento regulador específico de semillas se encontró solo en el promotor. Un análisis adicional del patrón de expresión mostró que los miembros se expresan ampliamente en tallos, brotes, semillas en desarrollo y silicuas. Estos hallazgos proporcionan información sobre los genes y enriquecen nuestra comprensión de su caracterización funcional.
Descripción
BARLEY B-RECOMBINANT/BASIC PENTACYSTEINE (BBR/BPC), una familia de factores de transcripción específicos de plantas, es un grupo de factores de unión al motivo GAGA que controlan múltiples procesos de desarrollo del crecimiento y respuesta a estrés abiótico. Los BPC reclutan factores de remodelación de histonas para la represión transcripcional de los objetivos aguas abajo. Sin embargo, la información sobre los BnaBPCs sigue siendo poco clara. Aquí, identificamos 25 genes que se localizan principalmente en el núcleo, se localizan aleatoriamente en 16 cromosomas y se agrupan en tres subfamilias basadas en un análisis filogenético. Veinticinco genes exhiben relaciones sinténicas con otros genes, y los polipéptidos codificados por genes dentro de la misma subfamilia comparten motivos conservados y dominios proteicos similares. La expansión de los genes pasó por eventos de duplicación del genoma completo y selección purificadora en los genomas, y todos los genes tenían los mismos dominios de unión GAGA conservados. Además, el promotor de cada gen consistía en varios elementos asociados con estrés, fitohormonas y crecimiento y desarrollo. Notablemente, el elemento regulador específico de semillas se encontró solo en el promotor. Un análisis adicional del patrón de expresión mostró que los miembros se expresan ampliamente en tallos, brotes, semillas en desarrollo y silicuas. Estos hallazgos proporcionan información sobre los genes y enriquecen nuestra comprensión de su caracterización funcional.