Análisis de la Expresión Génica de Diferentes Órganos e Identificación de Factores de Transcripción AP2 en Lino (L.)
Autores: Qi, Fan; Wang, Fu; Xiaoyang, Chunxiao; Wang, Zhenhui; Lin, Yujie; Peng, Zhanwu; Zhang, Jun; Wang, Ningning; Zhang, Jian
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis de la Expresión Génica de Diferentes Órganos e Identificación de Factores de Transcripción AP2 en Lino (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Linaza
Expresión génica
órganos
Factores de transcripción AP2
Patrones de crecimiento
Datos de RNA-seq
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
El lino (L.) es un cultivo oleaginoso importante, ampliamente cultivado por su aceite y fibra. Este estudio realizó un análisis de transcriptoma para analizar los perfiles de expresión génica de raíces, hojas, estambres, pistilos y frutos en el cultivar de lino Longya10. Se detectaron un total de 43,471 genes en los datos de RNA-seq, con 34,497 genes mostrando niveles de expresión diferencial entre diferentes órganos. Los patrones de expresión génica variaron entre los diferentes órganos, con diferencias observadas en los genes reguladores de la expresión dentro de órganos específicos. Sin embargo, se encontró que 23,448 genes se expresaban comúnmente en todos los órganos. Un análisis adicional reveló expresiones génicas específicas de órganos, con 236, 690, 544, 909 y 1212 genes identificados en pistilos, frutos, hojas, raíces y estambres, respectivamente. Se realizó un análisis de enriquecimiento de la Ontología Génica (GO) en estos genes específicos de órganos, y se observó un enriquecimiento significativo en varios procesos biológicos, componentes celulares y funciones moleculares, proporcionando nuevas perspectivas sobre los patrones de crecimiento específicos de los órganos de lino. Además, investigamos las diferencias de expresión de los factores de transcripción AP2 en varios tejidos y órganos de Longya10. Identificamos 96 genes AP2 que se expresaron diferencialmente en diferentes órganos y los anotamos en varias vías biológicas. Nuestros resultados sugieren que los factores de transcripción AP2 pueden desempeñar roles importantes en la regulación del crecimiento y desarrollo de los órganos de lino, incluida la respuesta al estrés. En resumen, nuestro estudio proporciona un análisis integral de los patrones de expresión génica en diferentes órganos y tejidos de la planta de lino e identifica posibles reguladores críticos del crecimiento y desarrollo de los órganos de lino. Estos hallazgos contribuyen a una mejor comprensión de los mecanismos moleculares subyacentes al desarrollo de los órganos de lino y pueden tener importantes implicaciones para la mejora genética de los cultivos de lino.
Descripción
El lino (L.) es un cultivo oleaginoso importante, ampliamente cultivado por su aceite y fibra. Este estudio realizó un análisis de transcriptoma para analizar los perfiles de expresión génica de raíces, hojas, estambres, pistilos y frutos en el cultivar de lino Longya10. Se detectaron un total de 43,471 genes en los datos de RNA-seq, con 34,497 genes mostrando niveles de expresión diferencial entre diferentes órganos. Los patrones de expresión génica variaron entre los diferentes órganos, con diferencias observadas en los genes reguladores de la expresión dentro de órganos específicos. Sin embargo, se encontró que 23,448 genes se expresaban comúnmente en todos los órganos. Un análisis adicional reveló expresiones génicas específicas de órganos, con 236, 690, 544, 909 y 1212 genes identificados en pistilos, frutos, hojas, raíces y estambres, respectivamente. Se realizó un análisis de enriquecimiento de la Ontología Génica (GO) en estos genes específicos de órganos, y se observó un enriquecimiento significativo en varios procesos biológicos, componentes celulares y funciones moleculares, proporcionando nuevas perspectivas sobre los patrones de crecimiento específicos de los órganos de lino. Además, investigamos las diferencias de expresión de los factores de transcripción AP2 en varios tejidos y órganos de Longya10. Identificamos 96 genes AP2 que se expresaron diferencialmente en diferentes órganos y los anotamos en varias vías biológicas. Nuestros resultados sugieren que los factores de transcripción AP2 pueden desempeñar roles importantes en la regulación del crecimiento y desarrollo de los órganos de lino, incluida la respuesta al estrés. En resumen, nuestro estudio proporciona un análisis integral de los patrones de expresión génica en diferentes órganos y tejidos de la planta de lino e identifica posibles reguladores críticos del crecimiento y desarrollo de los órganos de lino. Estos hallazgos contribuyen a una mejor comprensión de los mecanismos moleculares subyacentes al desarrollo de los órganos de lino y pueden tener importantes implicaciones para la mejora genética de los cultivos de lino.