La gestión de las invasiones biológicas se encuentra entre los desafíos globales más urgentes y requiere un esfuerzo de monitoreo significativo para obtener la información necesaria para tomar las decisiones adecuadas. Para complementar el monitoreo estándar, la ciencia ciudadana se está utilizando cada vez más. Dentro de la ciencia ciudadana, el enfoque de recopilar e investigar el Conocimiento Ecológico Local (LEK) ha demostrado ser útil en el monitoreo de especies no nativas. Se llevó a cabo una encuesta de LEK en 10 sitios de Natura 2000 en Sicilia y Malta con el fin de ayudar en la detección temprana de especies no nativas. La encuesta se dirigió a pescadores locales y buceadores para investigar la ocurrencia de 24 especies marinas no nativas seleccionadas e identificar áreas potenciales de puntos críticos de invasión a través del uso de seis indicadores: la ocurrencia de especies no indígenas recién introducidas, los impactos acumulativos de especies exóticas invasoras (CIMPAL) y la importancia relativa de las especies sobre los impactos acumulativos (D1, D2, D3 y D4). Los encuestados confirmaron la presencia de 22 especies desde el año 2000 y reportaron 10 nuevas registradas en las áreas investigadas. El valor más alto de CIMPAL se observó en dos sitios de Natura 2000 en Sicilia (ITA090028 e ITA040014) y el más bajo en la costa occidental de Malta (MT0000101, MT0000102, MT0000103 y MT0000104). Las cuatro especies de máxima prioridad según los indicadores D1-D4 fueron , , y . El estudio produjo un resultado científico válido y útil para sugerir y abordar estrategias de gestión para monitorear el establecimiento de las especies no nativas.