Doscientos veinticinco aislamientos fueron recolectados entre 2005 y 2019 en huertos de almendros que mostraban síntomas de cancro de ramas y marchitez de brotes en cinco regiones diferentes de España. El análisis de secuencias de ADN de varios loci con cinco loci (ITS, , , y ), permitió la identificación de cuatro especies conocidas, a saber: , , y . Además, se describió una nueva especie filogenética, . fue la especie más prevalente, debido al mayor número de aislamientos (85.3%) obtenidos de todas las regiones muestreadas. La segunda especie más frecuente fue (10.2%), seguida por (3.6%), y , cada una con solo un aislamiento. Se realizaron pruebas de patogenicidad utilizando ramitas de almendro de un año de edad cv. Vayro e aislamientos representativos de las diferentes especies. Excepto por y , todas las especies fueron capaces de causar lesiones significativamente diferentes de las desarrolladas en los controles no inoculados. causó los síntomas más graves. Estos resultados confirman como un patógeno clave de los almendros en España. Además, la nueva especie, , también debe considerarse como un agente causal potencialmente importante de los cancro de ramas y la marchitez de brotes en este cultivo.