Los componentes volátiles son un factor clave en la identificación de muestras, el análisis diferencial, el control de calidad y la trazabilidad del origen. Para identificar y analizar las diferencias en las sustancias volátiles en diferentes semillas de alfalfa, este estudio utilizó cromatografía de gases-espectrometría de movilidad iónica (GC-IMS), combinada con el complemento Gallery Plot, y PCA, PLS-DA y otros métodos de análisis. De esta manera, se realizó un análisis exhaustivo de los componentes volátiles en 10 semillas de alfalfa, incluidas las variedades aeroespaciales. Un análisis comparativo de las características de diferentes compuestos de muestra utilizando mapas topográficos y huellas dactilares llevó al aislamiento de 48 tipos de 54 compuestos volátiles. Entre ellos, se encontró que los ésteres (9 tipos), olefinas (8 tipos), cetonas (8 tipos), alcoholes (6 tipos) y aldehídos (6 tipos) eran los compuestos volátiles más abundantes en las semillas de alfalfa. Al mismo tiempo, los modelos de análisis de PCA y PLS-DA mostraron que los ésteres, cetonas y alcoholes eran los principales volátiles que causaban las diferencias entre las semillas de alfalfa. Entre ellos, el contenido de varias sustancias en las variedades aeroespaciales ZT2 y ZT3 era mayor que el de otras variedades, mientras que los tipos y contenidos de volátiles en ZT1, ZM2 y GN3 eran relativamente bajos. Por lo tanto, en combinación con las diferencias en la madurez de cada muestra, las 10 variedades de alfalfa finalmente se dividieron en tres categorías, y las variedades de la misma serie se clasificaron básicamente en una categoría. Esto proporciona una base y facilidad para futuras selecciones de semillas, identificación, trazabilidad y crianza de forraje.