Diferencias en la expresión génica en semillas de soja germinadas entre cuatro cultivares, identificadas mediante secuenciación de ARN de alto rendimiento de una sola semilla
Autores: Nakamura, Kosuke; Gondo, Takahiro; Chiba, Shinji; Akimoto, Satoshi; Narushima, Jumpei; Kondo, Kazunari; Sugano, Yohei; Tanaka, Hidenori; Hashiguchi, Masatsugu; Shiwa, Yuh; Akashi, Ryo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Diferencias en la expresión génica en semillas de soja germinadas entre cuatro cultivares, identificadas mediante secuenciación de ARN de alto rendimiento de una sola semilla
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales
Palabras clave
Expresión génica
Semillas individuales
Cultivares de soja
SsRNA-seq
Williams 82
Nutrientes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 27
Citaciones: Sin citaciones
La expresión génica en semillas germinadas individuales de cuatro cultivares diferentes de soja ( [L.] Merr.), GL3494, OAC Kent, Williams 82 y Jackson, fue examinada utilizando secuenciación de ARN de alto rendimiento de una sola semilla (ssRNA-seq). La expresión génica fue similar entre dos semillas individuales del mismo cultivar, pero diferente entre semillas individuales de los cuatro cultivares. Especialmente, ssRNA-seq identificó cinco genes que no se expresaron de manera estable en Williams 82, teniendo o bien ninguna lectura de secuencia detectable o menos de cinco lecturas de secuencia mapeadas a las regiones de exones de los cromosomas en Williams 82. Estos hallazgos fueron validados mediante análisis de reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa. Los resultados del estudio demuestran que la expresión génica en semillas germinadas es única para cada semilla individual de cada cultivar de soja. Esta singularidad puede afectar la composición y contenido de nutrientes en las semillas germinadas de soja utilizadas como ingredientes alimenticios.
Descripción
La expresión génica en semillas germinadas individuales de cuatro cultivares diferentes de soja ( [L.] Merr.), GL3494, OAC Kent, Williams 82 y Jackson, fue examinada utilizando secuenciación de ARN de alto rendimiento de una sola semilla (ssRNA-seq). La expresión génica fue similar entre dos semillas individuales del mismo cultivar, pero diferente entre semillas individuales de los cuatro cultivares. Especialmente, ssRNA-seq identificó cinco genes que no se expresaron de manera estable en Williams 82, teniendo o bien ninguna lectura de secuencia detectable o menos de cinco lecturas de secuencia mapeadas a las regiones de exones de los cromosomas en Williams 82. Estos hallazgos fueron validados mediante análisis de reacción en cadena de la polimerasa de transcripción inversa. Los resultados del estudio demuestran que la expresión génica en semillas germinadas es única para cada semilla individual de cada cultivar de soja. Esta singularidad puede afectar la composición y contenido de nutrientes en las semillas germinadas de soja utilizadas como ingredientes alimenticios.