El pipeline bioinformático previamente desarrollado en nuestro laboratorio de investigación se utiliza para identificar posibles genes tumorales y factores de transcripción desregulados, tanto generales como específicos, relacionados con el establecimiento y la progresión de enfermedades tumorales, comparando ahora el cáncer de pulmón con otros dos tipos de cáncer. Se seleccionaron y analizaron por separado veinte conjuntos de datos de microarreglos para identificar genes expresados diferencialmente centrales y se compararon para identificar todos los genes y factores de transcripción desregulados en común entre los tres tipos de cáncer y aquellos únicos del cáncer de pulmón. El análisis de los DEGs ganadores permitió identificar un número importante de TFs desregulados en la mayoría de los conjuntos de datos de microarreglos, que pueden convertirse en biomarcadores clave de tumores generales y específicos del cáncer de pulmón. Se construyó una red de coexpresión para cada conjunto de datos con todos los genes desregulados asociados con el cáncer de pulmón, de acuerdo con el análisis de enriquecimiento de la herramienta DAVID, y factores de transcripción capaces de regularlos, según la herramienta oPOSSUM. Varios genes y factores de transcripción están coexpresados en las redes, sugiriendo que podrían estar relacionados con el establecimiento o la progresión de la patología tumoral en cualquier tejido y específicamente en el pulmón. La comparación de las redes de coexpresión del cáncer de pulmón y otros tipos de cáncer permitió la identificación de patrones de conectividad comunes con genes desregulados y factores de transcripción correlacionados a procesos tumorales importantes y vías de señalización que aún no se han estudiado para validar experimentalmente su papel en el cáncer de pulmón. El estimador de Kaplan-Meier determinó la asociación de trece factores de transcripción desregulados ganadores con la supervivencia de pacientes con cáncer de pulmón. El análisis de coregulación identificó dos redes de factores de transcripción ganadores relacionadas con el control regulador de la expresión génica en el cáncer de pulmón y de mama. Nuestro análisis transcriptómico sugiere que el cáncer tiene una importante red de coregulación de factores de transcripción relacionada con la adquisición de las características del cáncer. Además, el cáncer de pulmón tiene un grupo de genes y factores de transcripción únicos del tejido pulmonar que están coexpresados durante la tumorogénesis y deben ser estudiados experimentalmente para comprender completamente su papel en la patogénesis dentro de su escenario transcriptómico muy complejo. Por lo tanto, el análisis bioinformático desarrollado fue capaz de identificar una metafirma de coregulación del cáncer en general y específica del cáncer de pulmón, teniendo en cuenta la gran heterogeneidad del proceso tumoral a niveles celulares y poblacionales.