La identificación del área prioritaria es de gran importancia para la disposición racional de las áreas protegidas de ríos (APR), y también plantea nuevos desafíos para la construcción de áreas protegidas (AP). Este estudio comenzó con las características de las APR y eligió la provincia de Sichuan en China como caso para el presente estudio, basado en sus características de valor de conservación de la biodiversidad y otros elementos característicos. El estudio seleccionó el índice de conectividad dendrítica de ríos y otros cuatro indicadores, sumándolos según diferentes pesos para calcular el área de valor protegido integral (VPI). Finalmente, se compararon las distribuciones de AP existentes dentro del VPI y se identificó el área de conservación prioritaria. Las principales conclusiones son las siguientes: el área total de áreas de alto valor es de aproximadamente 175,068 km2, lo que representa el 36.02% de la provincia y se concentra en las mesetas de alta montaña del noroeste y la región montañosa suroeste; las AP existentes tienen un tamaño de 131,687 km2, cubriendo solo el 25.08% de las áreas de alto valor del VPI. En otras palabras, el 74.92% de las áreas de alto valor aún no han sido protegidas de manera efectiva, y la construcción de APR está relativamente rezagada en estas áreas; el área total de las áreas de conservación prioritaria (ACP) es de 131,162 km2, lo que representa aproximadamente el 26.99% de la provincia. La longitud total del tramo en las ACP es de aproximadamente 9190.72 km, que es aproximadamente el 26.84% de la longitud de los tramos alternativos de la provincia. La investigación puede proporcionar una base científica para la optimización e integración de las áreas protegidas de la naturaleza y la planificación del espacio terrestre.