Distribución genómica de nuevos mini-satélites Ta-3A1 en toda la extensión del genoma y su uso para la identificación de cromosomas en trigo y especies relacionadas
Autores: Lang, Tao; Li, Guangrong; Yu, Zhihui; Ma, Jiwei; Chen, Qiheng; Yang, Ennian; Yang, Zujun
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2019
Acceso abierto
Artículo científico
2019
Distribución genómica de nuevos mini-satélites Ta-3A1 en toda la extensión del genoma y su uso para la identificación de cromosomas en trigo y especies relacionadas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Repeticiones en tándem
ADN satélite
Ta-3A1
Genoma de trigo
Hibridación in situ por fluorescencia
Reordenamientos cromosómicos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 32
Citaciones: Sin citaciones
Una gran proporción de los genomas de las gramíneas está compuesta por repeticiones en tándem (TRs), que incluyen ADN satelital. Se descubrió que una secuencia de ADN mini-satélite con una longitud de 44 pares de bases, llamada Ta-3A1, se acumulaba en gran medida en el genoma del trigo, como se reveló mediante un análisis exhaustivo de secuencias. La distribución física de Ta-3A1 en los cromosomas 3A, 5A, 5B, 5D y 7A del trigo fue confirmada mediante hibridación in situ por fluorescencia no desnaturalizante (ND-FISH) después de etiquetar la sonda de oligonucleótidos. El análisis de las variantes del monómero indicó que la amplificación rápida de secuencias de Ta-3A1 ocurrió primero en los cromosomas del grupo de ligamiento 5, luego en los grupos 3 y 7. El análisis comparativo de ND-FISH sugirió que ocurrieron cambios rápidos en el número de copias y las ubicaciones cromosómicas de Ta-3A1 entre las diferentes especies de la tribu Triticeae, lo que podría haber estado asociado con reordenamientos cromosómicos durante la especiación y la poliploidización. La etiquetado y el posterior uso de Ta-3A1 mediante ND-FISH pueden ayudar en la identificación precisa y documentación de nuevos germoplasmas de trigo modificados por manipulación cromosómica.
Descripción
Una gran proporción de los genomas de las gramíneas está compuesta por repeticiones en tándem (TRs), que incluyen ADN satelital. Se descubrió que una secuencia de ADN mini-satélite con una longitud de 44 pares de bases, llamada Ta-3A1, se acumulaba en gran medida en el genoma del trigo, como se reveló mediante un análisis exhaustivo de secuencias. La distribución física de Ta-3A1 en los cromosomas 3A, 5A, 5B, 5D y 7A del trigo fue confirmada mediante hibridación in situ por fluorescencia no desnaturalizante (ND-FISH) después de etiquetar la sonda de oligonucleótidos. El análisis de las variantes del monómero indicó que la amplificación rápida de secuencias de Ta-3A1 ocurrió primero en los cromosomas del grupo de ligamiento 5, luego en los grupos 3 y 7. El análisis comparativo de ND-FISH sugirió que ocurrieron cambios rápidos en el número de copias y las ubicaciones cromosómicas de Ta-3A1 entre las diferentes especies de la tribu Triticeae, lo que podría haber estado asociado con reordenamientos cromosómicos durante la especiación y la poliploidización. La etiquetado y el posterior uso de Ta-3A1 mediante ND-FISH pueden ayudar en la identificación precisa y documentación de nuevos germoplasmas de trigo modificados por manipulación cromosómica.