La familia de genes es una de las familias más importantes de factores de transcripción que tienen diversas funciones en el crecimiento y los procesos de desarrollo de las plantas, incluyendo el patrón del meristemo axilar, la transducción de señales, el mantenimiento celular, y la señalización de fitohormonas y luz. A pesar de su importancia, la función de los genes en el fruto de pitaya (L.) sigue siendo desconocida. Aquí, se identificaron 45 miembros de la familia de genes en el genoma de pitaya, que se distribuyeron en 11 cromosomas. Todos los 45 miembros fueron agrupados en nueve subfamilias utilizando análisis filogenético con seis otras especies: maíz, arroz, soja, tomates y Arabidopsis. Entre los 45 genes, se seleccionaron 12 genes de datos de RNA-Seq debido a su mayor expresión en diferentes tejidos de la planta de pitaya. Para verificar los datos de RNA-Seq, estos 12 genes fueron sometidos a validación por qRT-PCR. Nueve genes mostraron una mayor expresión relativa en diferentes tejidos de la planta. Estos nueve genes, que fueron categorizados en seis subfamilias incluyendo DELLA (), SCL-3 (), PAT1 (, , ), HAM (), SCR () y LISCL (, ), podrían regular el crecimiento y desarrollo en la planta de pitaya. Los resultados del presente estudio proporcionan información valiosa para mejorar la pitaya tropical a través de un programa de cría molecular y convencional.