Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión del Factor de Transcripción en Alfalfa Anual
Autores: Yang, Linghua; Min, Xueyang; Wei, Zhenwu; Liu, Nana; Li, Jiaqing; Zhang, Youxin; Yang, Yuwei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión del Factor de Transcripción en Alfalfa Anual
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factor de transcripción
Genes
Desarrollo de plantas
Respuesta al estrés
Respuesta hormonal
Análisis de expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
El factor de transcripción es una familia de genes de transcripción específica de plantas que desempeña diversas funciones biológicas en el desarrollo de las plantas y la respuesta al estrés. Sin embargo, no se ha realizado ninguna investigación relevante sobre . Aquí, se identificaron 36 genes en el genoma y se dividieron en 10 grupos basados en el análisis filogenético comparativo. La información esencial de los genes, como la localización cromosómica, la estructura del gen, los motivos conservados y las presiones selectivas, se analizaron sistemáticamente. Se predijo que los 36 genes contenían más elementos de acción relacionados con la respuesta hormonal y se predijo que interactuaban y participaban en el proceso de floración del fotoperíodo. Los genes mostraron un patrón de expresión diverso en diferentes tejidos. Notablemente, se expresaron específicamente en la vaina grande y la raíz, respectivamente, lo que sugiere su papel crucial en el desarrollo de la vaina y la raíz. El análisis de qRT-PCR indicó que los niveles de expresión de , , , y estaban claramente regulados al alza bajo estrés por sequía, sal y frío. En conjunto, la identificación a nivel genómico, el análisis evolutivo y el análisis de expresión de la familia de genes de transcripción en proporcionarán nueva información para comprender y utilizar mejor la función de estos genes en las plantas.
Descripción
El factor de transcripción es una familia de genes de transcripción específica de plantas que desempeña diversas funciones biológicas en el desarrollo de las plantas y la respuesta al estrés. Sin embargo, no se ha realizado ninguna investigación relevante sobre . Aquí, se identificaron 36 genes en el genoma y se dividieron en 10 grupos basados en el análisis filogenético comparativo. La información esencial de los genes, como la localización cromosómica, la estructura del gen, los motivos conservados y las presiones selectivas, se analizaron sistemáticamente. Se predijo que los 36 genes contenían más elementos de acción relacionados con la respuesta hormonal y se predijo que interactuaban y participaban en el proceso de floración del fotoperíodo. Los genes mostraron un patrón de expresión diverso en diferentes tejidos. Notablemente, se expresaron específicamente en la vaina grande y la raíz, respectivamente, lo que sugiere su papel crucial en el desarrollo de la vaina y la raíz. El análisis de qRT-PCR indicó que los niveles de expresión de , , , y estaban claramente regulados al alza bajo estrés por sequía, sal y frío. En conjunto, la identificación a nivel genómico, el análisis evolutivo y el análisis de expresión de la familia de genes de transcripción en proporcionarán nueva información para comprender y utilizar mejor la función de estos genes en las plantas.