Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de los genes (CaM) y (CML) en las algas pardas
Autores: Xue, Nianchao; Sun, Minghui; Gai, Zihan; Bai, Meihan; Sun, Juan; Sai, Shan; Zhang, Linan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de los genes (CaM) y (CML) en las algas pardas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Calmodulinas
Proteínas similares a calmodulina
Algas pardas
Evolución
Respuestas al estrés
Crecimiento
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
Los calmodulinas (CaMs) y las proteínas similares a calmodulina (CMLs) son vitales en el crecimiento, desarrollo y respuestas al estrés de las plantas. Sin embargo, los CaMs y CMLs no han sido completamente identificados y caracterizados en las algas pardas, que han evolucionado de manera independiente de la línea de plantas verdes bien estudiada. En este estudio, las búsquedas de genomas completos revelaron un SjCaM y ocho SjCMLs en , y un EsCaM y once EsCMLs en sp. SjCaM y EsCaM codificaron productos de proteínas idénticos y compartieron un 88.59-89.93% de identidad de aminoácidos con AtCaMs, lo que indica que los CaMs de las algas pardas retuvieron una función similar de sensores de Ca como en las plantas. Los resultados del análisis filogenético y de la estructura génica mostraron que hubo una divergencia significativa en las secuencias génicas entre los CMLs de las algas pardas. Además, el análisis evolutivo indicó que la función de los CMLs de las algas pardas fue relativamente conservada, lo que puede estar relacionado con el hecho de que las algas pardas no necesitan enfrentar entornos complejos como las plantas terrestres. La predicción de elementos reguladores y el análisis de expresión revelaron el probable funcionamiento de los genes SjCaM/CML en el desarrollo de gametofitos y la respuesta al estrés en . Además, se predijeron preliminarmente las proteínas y químicos que interactúan con SjCaM/SjCMLs, sugiriendo que SjCaM/SjCMLs podrían desempeñar roles putativos en los procesos de crecimiento y desarrollo mediados por Ca/CaM y en las respuestas a estímulos. Por lo tanto, estos resultados facilitarán nuestra comprensión de la evolución de los CaMs/CMLs de las algas pardas y la identificación funcional de SjCaM/SjCMLs.
Descripción
Los calmodulinas (CaMs) y las proteínas similares a calmodulina (CMLs) son vitales en el crecimiento, desarrollo y respuestas al estrés de las plantas. Sin embargo, los CaMs y CMLs no han sido completamente identificados y caracterizados en las algas pardas, que han evolucionado de manera independiente de la línea de plantas verdes bien estudiada. En este estudio, las búsquedas de genomas completos revelaron un SjCaM y ocho SjCMLs en , y un EsCaM y once EsCMLs en sp. SjCaM y EsCaM codificaron productos de proteínas idénticos y compartieron un 88.59-89.93% de identidad de aminoácidos con AtCaMs, lo que indica que los CaMs de las algas pardas retuvieron una función similar de sensores de Ca como en las plantas. Los resultados del análisis filogenético y de la estructura génica mostraron que hubo una divergencia significativa en las secuencias génicas entre los CMLs de las algas pardas. Además, el análisis evolutivo indicó que la función de los CMLs de las algas pardas fue relativamente conservada, lo que puede estar relacionado con el hecho de que las algas pardas no necesitan enfrentar entornos complejos como las plantas terrestres. La predicción de elementos reguladores y el análisis de expresión revelaron el probable funcionamiento de los genes SjCaM/CML en el desarrollo de gametofitos y la respuesta al estrés en . Además, se predijeron preliminarmente las proteínas y químicos que interactúan con SjCaM/SjCMLs, sugiriendo que SjCaM/SjCMLs podrían desempeñar roles putativos en los procesos de crecimiento y desarrollo mediados por Ca/CaM y en las respuestas a estímulos. Por lo tanto, estos resultados facilitarán nuestra comprensión de la evolución de los CaMs/CMLs de las algas pardas y la identificación funcional de SjCaM/SjCMLs.