Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión de la Familia de Genes en Soja
Autores: Zhou, Yueqiong; He, Liangliang; Zhou, Shaoli; Wu, Qing; Zhou, Xuan; Mao, Yawen; Zhao, Baolin; Wang, Dongfa; Zhao, Weiyue; Wang, Ruoruo; Hu, Huabin; Chen, Jianghua
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión de la Familia de Genes en Soja
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Importante
Citoesqueleto de actina
Soja
Legumbres
Familia de genes
Relaciones filogenéticas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
La proteína VILLIN (VLN) es un regulador importante del citoesqueleto de actina, que orquesta muchos procesos de desarrollo y participa en diversas respuestas bióticas y abióticas en las plantas. Aunque la familia de genes y sus posibles funciones han sido analizadas en varias plantas, el conocimiento sobre los genes en sojas y legumbres sigue siendo bastante limitado. En este estudio, se caracterizaron un total de 35 VLNs de soja y cinco legumbres relacionadas. Combinando con las secuencias de VLN de otras nueve plantas terrestres, categorizamos la familia de genes en tres grupos según las relaciones filogenéticas. Un análisis más detallado de los VLNs de soja indicó que los diez estaban distribuidos en 10 de los 20 cromosomas, y sus estructuras genéticas y motivos proteicos mostraron altas especificidades grupales. El análisis del patrón de expresión sugirió que la mayoría se expresa ampliamente en varios tejidos, pero tres miembros tienen un nivel muy alto en semillas. Además, observamos que los elementos cis enriquecidos en los promotores están principalmente relacionados con estrés abiótico, señales hormonales y procesos de desarrollo. El mayor número de elementos cis se asoció con respuestas a la luz, y dos, , y aumentaron significativamente bajo condiciones de luz prolongada. Este estudio no solo proporciona información básica sobre la familia de genes, sino que también ofrece una buena referencia para caracterizar más a fondo las diversas funciones de los genes en sojas.
Descripción
La proteína VILLIN (VLN) es un regulador importante del citoesqueleto de actina, que orquesta muchos procesos de desarrollo y participa en diversas respuestas bióticas y abióticas en las plantas. Aunque la familia de genes y sus posibles funciones han sido analizadas en varias plantas, el conocimiento sobre los genes en sojas y legumbres sigue siendo bastante limitado. En este estudio, se caracterizaron un total de 35 VLNs de soja y cinco legumbres relacionadas. Combinando con las secuencias de VLN de otras nueve plantas terrestres, categorizamos la familia de genes en tres grupos según las relaciones filogenéticas. Un análisis más detallado de los VLNs de soja indicó que los diez estaban distribuidos en 10 de los 20 cromosomas, y sus estructuras genéticas y motivos proteicos mostraron altas especificidades grupales. El análisis del patrón de expresión sugirió que la mayoría se expresa ampliamente en varios tejidos, pero tres miembros tienen un nivel muy alto en semillas. Además, observamos que los elementos cis enriquecidos en los promotores están principalmente relacionados con estrés abiótico, señales hormonales y procesos de desarrollo. El mayor número de elementos cis se asoció con respuestas a la luz, y dos, , y aumentaron significativamente bajo condiciones de luz prolongada. Este estudio no solo proporciona información básica sobre la familia de genes, sino que también ofrece una buena referencia para caracterizar más a fondo las diversas funciones de los genes en sojas.