Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión de la Familia de Genes en Rosales (Jacq.)
Autores: Su, Wanyi; Deng, Yuzheng; Pan, Xuejuan; Li, Ailing; Zhu, Yongjie; Zhang, Jitao; Lu, Siting; Liao, Weibiao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión de la Familia de Genes en Rosales (Jacq.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Activador de la transcripción que se une a la calmodulina
Factores de transcripción
Respuestas al estrés en plantas
Desarrollo
Miembros de la familia de genes
Elementos de respuesta a la señalización de fitohormonas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
El activador de transcripción que se une a la calmodulina, como uno de los factores de transcripción, está involucrado en la realización de funciones importantes en la modulación de las respuestas al estrés y el desarrollo de las plantas en un modo impulsado por Ca/CaM. Sin embargo, el análisis a escala genómica de no se ha investigado sistemáticamente en rosas. Se identificaron miembros de la familia de genes de rosa (Jacq.) y se analizaron bioinformáticamente para investigar sus características de expresión en las respuestas hormonales de las plantas. Los resultados muestran que se identificaron un total de cinco genes de rosa. La localización cromosómica muestra que los miembros del gen se encontraban en los cromosomas 2, 4 y 7. El análisis de propiedades fisicoquímicas muestra que la longitud de su secuencia CDS varía de 500 a 1070 pb, el peso molecular varía de 55,531.60 a 120,252.98 Da, y el punto isoeléctrico está entre 5.04 y 8.54. El análisis filogenético muestra que los genes de rosa se clasifican en tres subfamilias. El análisis de motivos conservados revela la presencia de motivo 1, motivo 3, motivo 5, motivo 7 y motivo 10 en todos los genes. Los resultados de la predicción de elementos cis-actuantes muestran que la familia de genes de rosa contiene elementos de respuesta a señales de fitohormonas, respuestas a estrés abiótico, respuestas a la luz y otros elementos, la mayoría de los cuales son elementos de respuesta a señales hormonales. A partir de los niveles de expresión de los genes, los genes de la familia en rosas tienen diferentes patrones de expresión espacial en diferentes tejidos. El análisis de qRT-PCR mostró que los cinco genes de rosa respondieron al ácido salicílico (SA). fue inducido significativamente por el ácido abscísico (ABA), y fue inducido significativamente por el ácido 1H-indol-3-acético (IAA) y el metil jasmonato (MeJA). Así, proporcionamos una referencia básica para estudios posteriores sobre las funciones de las proteínas CAMTA en las plantas.
Descripción
El activador de transcripción que se une a la calmodulina, como uno de los factores de transcripción, está involucrado en la realización de funciones importantes en la modulación de las respuestas al estrés y el desarrollo de las plantas en un modo impulsado por Ca/CaM. Sin embargo, el análisis a escala genómica de no se ha investigado sistemáticamente en rosas. Se identificaron miembros de la familia de genes de rosa (Jacq.) y se analizaron bioinformáticamente para investigar sus características de expresión en las respuestas hormonales de las plantas. Los resultados muestran que se identificaron un total de cinco genes de rosa. La localización cromosómica muestra que los miembros del gen se encontraban en los cromosomas 2, 4 y 7. El análisis de propiedades fisicoquímicas muestra que la longitud de su secuencia CDS varía de 500 a 1070 pb, el peso molecular varía de 55,531.60 a 120,252.98 Da, y el punto isoeléctrico está entre 5.04 y 8.54. El análisis filogenético muestra que los genes de rosa se clasifican en tres subfamilias. El análisis de motivos conservados revela la presencia de motivo 1, motivo 3, motivo 5, motivo 7 y motivo 10 en todos los genes. Los resultados de la predicción de elementos cis-actuantes muestran que la familia de genes de rosa contiene elementos de respuesta a señales de fitohormonas, respuestas a estrés abiótico, respuestas a la luz y otros elementos, la mayoría de los cuales son elementos de respuesta a señales hormonales. A partir de los niveles de expresión de los genes, los genes de la familia en rosas tienen diferentes patrones de expresión espacial en diferentes tejidos. El análisis de qRT-PCR mostró que los cinco genes de rosa respondieron al ácido salicílico (SA). fue inducido significativamente por el ácido abscísico (ABA), y fue inducido significativamente por el ácido 1H-indol-3-acético (IAA) y el metil jasmonato (MeJA). Así, proporcionamos una referencia básica para estudios posteriores sobre las funciones de las proteínas CAMTA en las plantas.