Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de factores de transcripción WRKY en
Autores: Mu, Detian; Chen, Wenqiang; Shao, Yingying; Wilson, Iain W.; Zhao, Huan; Luo, Zuliang; Lin, Xiaodong; He, Jialong; Zhang, Yuan; Mo, Changming; Qiu, Deyou; Tang, Qi
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de factores de transcripción WRKY en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción
Procesos biológicos
Familia de genes
Expresión génica
Respuesta al estrés
Crecimiento de las plantas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción WRKY, como la familia de genes más grande en plantas superiores, desempeñan un papel importante en varios procesos biológicos, incluyendo el crecimiento y desarrollo, la regulación de metabolitos secundarios y la respuesta al estrés. En este estudio, realizamos una identificación y análisis a nivel genómico de los factores de transcripción WRKY. Se identificaron un total de 59 genes que se distribuyeron en los 14 cromosomas, y estos se clasificaron en tres grupos principales basados en relaciones filogenéticas. Cada uno de estos grupos tenía motivos conservados y estructuras génicas similares. Comparamos todos los genes con genes identificados de tres especies de plantas diversas, y los resultados implicaron que la duplicación segmentaria y la duplicación en tándem juegan un papel importante en los procesos evolutivos de la familia de genes. El análisis de la región promotora reveló que los genes incluían muchos elementos de acción relacionados con el crecimiento y desarrollo de las plantas, la respuesta a fitohormonas y tanto el estrés abiótico como biótico. Los perfiles de expresión provenientes de la base de datos del transcriptoma mostraron patrones de expresión de estos genes en cuatro tejidos diferentes y revelaron que la mayoría de los genes se expresan en las raíces de las plantas. Se encuestaron quince genes con motivos de respuesta a bajas temperaturas para su expresión génica bajo estrés por frío, mostrando que la mayoría de los genes mostraron una regulación continua hacia arriba durante el tratamiento con frío. Nuestro estudio proporciona una base para un estudio más profundo sobre la función y el mecanismo regulador de la familia de genes.
Descripción
Los factores de transcripción WRKY, como la familia de genes más grande en plantas superiores, desempeñan un papel importante en varios procesos biológicos, incluyendo el crecimiento y desarrollo, la regulación de metabolitos secundarios y la respuesta al estrés. En este estudio, realizamos una identificación y análisis a nivel genómico de los factores de transcripción WRKY. Se identificaron un total de 59 genes que se distribuyeron en los 14 cromosomas, y estos se clasificaron en tres grupos principales basados en relaciones filogenéticas. Cada uno de estos grupos tenía motivos conservados y estructuras génicas similares. Comparamos todos los genes con genes identificados de tres especies de plantas diversas, y los resultados implicaron que la duplicación segmentaria y la duplicación en tándem juegan un papel importante en los procesos evolutivos de la familia de genes. El análisis de la región promotora reveló que los genes incluían muchos elementos de acción relacionados con el crecimiento y desarrollo de las plantas, la respuesta a fitohormonas y tanto el estrés abiótico como biótico. Los perfiles de expresión provenientes de la base de datos del transcriptoma mostraron patrones de expresión de estos genes en cuatro tejidos diferentes y revelaron que la mayoría de los genes se expresan en las raíces de las plantas. Se encuestaron quince genes con motivos de respuesta a bajas temperaturas para su expresión génica bajo estrés por frío, mostrando que la mayoría de los genes mostraron una regulación continua hacia arriba durante el tratamiento con frío. Nuestro estudio proporciona una base para un estudio más profundo sobre la función y el mecanismo regulador de la familia de genes.