Identificación a nivel genómico de cacahuete y caracterización funcional en estrés por sal y sequía
Autores: Tang, Haohong; Yuan, Cuiling; Shi, Haonan; Liu, Feng; Shan, Shihua; Wang, Zhijun; Sun, Quanxi; Sun, Jie
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a nivel genómico de cacahuete y caracterización funcional en estrés por sal y sequía
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familia de genes
Especies de cacahuate
Perfil de expresión
Sal
Estrés por sequía
Caracterización funcional
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes incluye factores de transcripción de proteínas de dedo de zinc que regulan una multitud de procesos fisiológicos y de desarrollo en las plantas. Aunque se han determinado previamente familias de genes en varias plantas, los miembros y roles del maní son en gran medida desconocidos. En esta investigación, sobre la base de la identificación a nivel genómico en tres especies de maní, investigamos el perfil de expresión en varios tejidos y en respuesta a estrés por sal y sequía, y seleccionamos para la caracterización funcional. Identificamos un total de 77 en maní, que podrían agruparse en cinco subfamilias, con los genes del mismo ramo del mismo subgrupo teniendo estructuras comparables de exones e intrones. Además, se encontró un número significativo de elementos reguladores involucrados en la regulación de respuestas a la luz, hormonas y estrés abiótico en la región promotora del maní. Basado en el análisis de datos de transcriptoma y qRT-PCR, identificamos genes potenciales asociados con la tolerancia a la sal y la sequía. El silenciamiento utilizando silenciamiento génico inducido por virus comprometió la tolerancia de las plantas de maní a los estreses por sal y sequía. Los resultados de este estudio proporcionan conocimiento sobre el maní y establecen una base para futuras investigaciones sobre sus roles funcionales en el desarrollo y respuesta al estrés del maní.
Descripción
La familia de genes incluye factores de transcripción de proteínas de dedo de zinc que regulan una multitud de procesos fisiológicos y de desarrollo en las plantas. Aunque se han determinado previamente familias de genes en varias plantas, los miembros y roles del maní son en gran medida desconocidos. En esta investigación, sobre la base de la identificación a nivel genómico en tres especies de maní, investigamos el perfil de expresión en varios tejidos y en respuesta a estrés por sal y sequía, y seleccionamos para la caracterización funcional. Identificamos un total de 77 en maní, que podrían agruparse en cinco subfamilias, con los genes del mismo ramo del mismo subgrupo teniendo estructuras comparables de exones e intrones. Además, se encontró un número significativo de elementos reguladores involucrados en la regulación de respuestas a la luz, hormonas y estrés abiótico en la región promotora del maní. Basado en el análisis de datos de transcriptoma y qRT-PCR, identificamos genes potenciales asociados con la tolerancia a la sal y la sequía. El silenciamiento utilizando silenciamiento génico inducido por virus comprometió la tolerancia de las plantas de maní a los estreses por sal y sequía. Los resultados de este estudio proporcionan conocimiento sobre el maní y establecen una base para futuras investigaciones sobre sus roles funcionales en el desarrollo y respuesta al estrés del maní.